預防：H5N1的防治最有效的方法是研制疫苗。WHO推薦以H5N1原型的病毒株作為研制疫苗用病毒株。荷蘭的Akzo Nobel NV和美國葛蘭素史克公司研制人H5N1禽流感病毒疫苗。
治療：有實踐證明，對人感染H5N1治療有效的藥物是Roche公司生產的口服膠囊達菲（病毒神經氨酸酶抑制劑）。動物實驗證明可抗H5N1的藥物還有中國農科院蘭州畜牧與獸藥研究所、農業部新獸藥工程重點試驗室主任梁劍平博士領導的課題組研制的金絲桃素、雲南農業生態研究所研制的那氏壹號。
越南國立衛生和流行病學研究院從壹名患者體內分離到了抗達菲的H5N1的病毒株，動物試驗表明，美國葛蘭素史克公司生產的噴霧劑“樂感清”（Relenza）卻對這種變異病毒有效果。