RNA-seq即轉錄組測序技術，就是用高通量測序技術進行測序分析，反映出mRNA,smallRNA,noncodingRNA等或者其中壹些的表達水平。
轉錄組測序技術（RNA-seq）作為目前二代測序領域最普遍的技術手段而獲得廣泛應用，應運而生的多種方法各有特點、爭奇鬥艷。傳統方法通常需要富集mRAN，片段化mRNA，反轉錄和加接頭，及擴增等。缺點是只能每個樣品獨立建庫，獲得的全長轉錄組信息中絕大多信息在後期分析中極少用到，普遍存在建庫步驟多、耗時長、效率低、測序深度不夠、成本高等問題；如果成百上千的樣品需要測序，例如目前歷程研究經常必須進行的成千上萬樣品的大規模隊列研究，則效率十分低下。