1，站址不同:杭州南站站址位於浙江省杭州市蕭山區站前路1號；杭州東站站址位於浙江省杭州市江幹區全福橋路2號。
2.主要線路不同:杭州東站內主要線路有滬昆鐵路、宣杭鐵路、肖勇鐵路、滬昆高鐵、寧杭高鐵、杭甬高鐵、杭黃高鐵；杭州南站正線有滬昆鐵路、肖勇鐵路、杭甬高鐵、滬昆高鐵、杭黃高鐵。
杭州火車東站相關信息
杭州東站，位於中國浙江省杭州市上城區，隸屬於中國鐵路上海局集團有限公司，是杭州最完整的交通樞紐，是杭州鐵路樞紐的重要組成部分，也是全國大型鐵路樞紐站之壹。截至2019、12，杭州東站占地面積40萬平方米，總建築面積32萬平方米。車站有15站臺，***28個站臺面，30條軌道，並預留3套4線磁懸浮。
2065438+2009年9月25日，浙江杭州東站樞紐鐵路換乘地鐵啟動“免檢模式”。杭州東站樞紐地鐵安檢正式搬到鐵路到達大廳。乘客出高鐵站後無需安檢直接進入地鐵站，實現無縫換乘。
以上內容參考百度百科-杭州東站。