寶寶營養不良的主要癥狀是患兒發育遲緩，身材矮小，皮膚毛發無光澤，角膜蒼白，體重不增加甚至減少。臨床上還將營養不良病人分為消瘦型和水腫型。
消瘦型消瘦型主要表現是皮膚松弛，皮下脂肪減少，變薄無彈性，頭發枯黃，大便頻而量少有黏液。患兒的智能及動作均有不同程度的遲緩，體溫低於正常，脈搏慢，血壓偏低。
水腫型水腫型的主要癥狀，輕者僅有皮下水腫，重者可有生殖器、上肢、腹部以及顏面凹陷性水腫。少數患兒可有胸膜腔積水，少數人還可以出現皮膚紫癜，本型患兒以體重突然增加為水腫的可靠標誌。
並發癥對於長期的營養不良，患兒還可還可以出現各種並發癥，如佝僂病，各種感染，腹瀉，中耳炎，腎盂腎炎等。