主要講的熊貓阿寶（也就是神龍大俠）和五俠老虎、鶴、螳螂、蛇、猴子保衛山谷的生活。但是好景不長，鳳凰城以前的沈王爺制造了壹件可以毀滅功夫的復仇武器。他要讓功夫死掉，霸占整個中原。壹天，阿寶在和師傅說話。師傅告訴他，要靜下心來，才能發揮出最大的力量。正在這時，沈王爺派出的土匪（壹群狼）攻進了這個山谷，來搶奪制作毀滅武器的金屬。正當阿寶和五俠打得過癮時，阿寶看到最後壹只狼，突然產生了幻覺，他看到了自己是壹個小寶寶，還有他的爸爸媽媽。阿寶壹時昏迷，被狼人壹錘擊暈，狼人帶著金屬逃走了。
回到面館，阿寶的爸爸正在招攬客人。阿寶把爸爸叫到屋裏，問起了他小時候的故事。阿寶的爸爸這才說出了真相：有壹天，阿寶的爸爸（也就是那只鵝）正在搬運蔬菜做面的時候，發現壹只小熊貓被裝在菜筐裏，就把它放了出來，給他餵東西、哄他玩。從此，這只鵝就成了壹只熊貓的爸爸，這只小熊貓就是阿寶。
同時，沈王爺也入侵了鳳凰城，犀牛和鱷魚大俠都不是沈王爺的對手，被關在了牢中。山羊被帶到了鳳凰城主塔內。為沈王爺算命。山羊說會有壹個神龍大俠來消滅他。沈王爺難以置信
阿寶和五俠要去拯救中原了，他們乘著壹艘船，來到了鳳凰城。
壹進入鳳凰城，阿寶就要沖進去擊敗沈王爺。快螳螂和悍嬌虎拉住了阿寶。原來城裏全是沈王爺的狼隊，他們正在欺壓百姓。於是，他們從房頂上越過，找了壹個舞龍的假套蓋住了自己，往前走。有壹個狼人正在虐待百姓，五俠靈機壹動，用龍頭將狼人吞下，然後在裏面把狼人痛揍壹頓。五俠和阿寶又假裝把那個百姓叼進嘴裏，它說要去找犀牛和鱷魚。話沒說完，狼人的大批隊伍就追了上來，他們壹路“吞下了”壹群狼人，在假套裏把狼人們痛揍壹頓。
在壹路艱辛的過後，他們終於來到了牢房。正當阿寶扯開門放犀牛和鱷魚出來時，他們卻死活不出來，因為如果他們反抗，沈王爺就會把百姓殺光。正當他們爭執時，幾個狼人沖了進來，結果前兩個都被五俠打趴了，最後壹個想跑，五俠和阿寶追了起來。
五俠們左沖右撞，而阿寶卻慢吞吞的。於是阿寶弄了壹個小推車，拼命往前追。狼人往後面扔了很多東西，阿寶都順利的避開。最後壹次狼人扔了壹大群小兔子寶寶，小兔子寶寶好奇，就趴在阿寶的臉上不放。阿寶甩開也不是，不甩開也不是，最後把兔寶寶甩到了仙鶴那裏。
正當阿寶追上了狼人，想質問他時，卻發現自己已經在鳳凰城下了。五俠和阿寶被狼人們抓了起來。
此時，沈王爺已經準備好了見這只熊貓。因為五俠和阿寶戴了穴位手銬，無法用功夫逃脫。阿寶看見壹個很小的武器，就以為是毀滅武器，壹腳踢碎了他。誰知這只是個模型，真正的毀滅武器在沈王爺的背後。五俠終於成功掙脫，毀滅了武器。但正當阿寶要抓住沈王爺時，沈王爺突然孔雀開屏，孔雀屏上又露出了那紅色的印記，阿寶又產生了幻象。沈王爺趁機逃走了。
正當他們慶幸毀滅了武器時，塔對面的壹座塔上，架上了十幾臺毀滅武器。五俠和阿寶這才意識到，毀滅武器不只有壹個。於是，他們東躲西躲，終於躲過了毀滅武器。他們又來到了大牢，但這次是來避險了。五俠決定再次進攻，但怎麽也不讓阿寶去。無奈之下，阿寶說出了原因。但五俠扭頭就走了。
正當五俠與狼人激戰時，他們發現阿寶正抓在壹個鐵框上。阿寶使出全身力氣，終於爬了上來。但他又落入了壹個陷阱：壹個履帶式的陷阱，只要陷下去，就會被巖漿燒為灰燼。阿寶奮力奔跑，但還是沒有跑過。此時，悍嬌虎也在趕往阿寶的方向，營救阿寶。
很快，阿寶抓著履帶又翻了回來。沈王爺終於使出了終極武器，將阿寶打飛出了鳳凰城。五俠也被抓住了。
但慶幸的是，老山羊救了他，幫他回憶起了真相：有壹天，沈王爺入侵了他們的村子，阿寶的爸爸英勇殺敵，最終被廢墟掩埋了。阿寶的媽媽帶著孩子逃進了林子，但狼人也追了上來。無奈之下，阿寶的媽媽把阿寶裝進了即將運走的菜筐中，希望有人能收養它，把它撫養成人。沈王爺把阿寶壹家三口拆散了……………………
阿寶重新回到了鳳凰城，挑戰沈王爺的終極武器。沈王爺怎麽也瞄不準，阿寶混進了狼堆，與狼打鬥。沈王爺開也開不得，不開也不行。開的話，自己的戰士將全部陪葬，不開炮，五俠將被解救。正當沈王爺腦亂時，五俠已經被解救，也混入了狼堆。這時，犀牛和鱷魚也來到了這裏。緊接著，就是五俠的師傅，也來到鳳凰城，幫助他們消滅沈王爺的武器。無奈之下，沈王爺下令開炮，狼人和五俠、犀牛、鱷魚、阿寶、師傅，全部被打入水中。
正當沈王爺要開炮消滅神龍大俠時，神龍大俠想起了師傅的話，心靜。。心靜。。他將炮彈化為水滴，抓起炮彈，投入水中。這時，阿寶壹心急，才看到手上已經被燙傷了。緊接著，又是無數的炮彈。阿寶都將炮彈抓住，扭轉到水裏。沈王爺發瘋了，連開炮彈，擊退阿寶。阿寶壹個個把炮彈接住，在手中像揉面團壹樣，揉成了壹個太極圈，阿寶把太極圈推到了沈王爺的船上，沈王爺被炸飛了。
當沈王爺醒來時，阿寶就站在面前。沈王爺企圖暗算他，結果被阿寶打敗。
阿寶終於回到了面館，他爸爸也很欣慰。阿寶發誓，以後永遠是他的兒子。
又在某壹個地方，阿寶的親爸爸發出了疑問：“我的兒子還活著？“
全劇終