保密工作存在問題及整改措施如下：
壹、組織幹部職工進行保密教育的力度不夠，保密意識不強。
整改措施：加強全局幹部職工的保密宣傳教育，提高保密意識，規範文件資料的管理，強化責任意識，落實責任制和責任追究制。
二、保密制度在落實上有打折扣的現象。
整改措施：加強網絡的維護和管理，制定具體的措施和辦法，加強督促檢查，確保整改取得實質性的效果。
保密制度：
1、建立健全收發文制度，各科室要有專人負責履行文件登記、管理和清退工作，發現屬於國家秘級文件資料丟失、被竊、泄密時，必須立即報告，及時追查，力挽損失。
2、各部門年終清退與本部門無關的並無保存價值的文件和壹些刊物，必須進行銷毀或碎紙處理，不得擅自出售。
3、檔案專、兼職管理人員對秘密檔案材料應嚴加管理，嚴格傳遞、借閱手續，如需借閱者，須經分管領導批準，並在檔案閱覽室內查閱，不準帶出檔案室，不準摘抄；檔案人員未經批準，不得擅自擴大利用範圍，以確保檔案的安全。
4、計算機房要建立健全各項管理制度，進入機房必須進行審批和登記制度，確定專人負責計算機的應用管理。凡秘密數據的傳輸和存貯均應采取相應的保密措施，錄有文件的軟盤信息要妥善保管，嚴防丟失。