1、職責不同：基金管理人，主要負責基金的投資決策、組合構建、資產配置、買賣證券的操作以及基金的日常管理。他們根據基金合同的規定，運用專業知識和技能，為基金投資人追求最大化的投資回報，並負責基金產品的設計、市場營銷、份額的登記與轉讓、定期報告的編制等工作。
基金托管人，主要職責是保管基金資產，確保基金財產的安全性和完整性。他們開設獨立的基金托管賬戶，對基金管理人的投資指令進行復核和執行，監督基金管理人的投資運作是否符合法律法規和基金合同的要求，負責基金的資金清算、會計核算、凈值計算、信息披露等工作，保障基金持有人的利益不受侵害。
2、法律責任與義務不同：基金管理人對基金的投資績效負直接責任，要確保投資決策的合規性和合理性。基金托管人對基金資產的安全負有法律義務，必須履行嚴格的托管職責，不得挪用、侵占基金資產。
3、收益來源不同：基金管理人通過收取基金管理費、業績報酬等方式獲得收入。基金托管人則通過收取托管費作為服務收入。
資格要求不同：基金管理人通常由符合監管要求的專業投資管理機構擔任，如基金管理公司。基金托管人壹般由商業銀行、信托公司等具備基金托管資格的金融機構擔任，須滿足監管部門嚴格的資本充足率、風險控制、專業團隊建設等方面的要求。