1880年11月1日出生於德國柏林。
1905年獲得柏林洪堡大學天文學博士學位。
1906年--1908年參加丹麥遠征格陵蘭的探險隊。格陵蘭北部探險。
1908年探險歸來，在馬寶大學就職，整理探險搜集的大量資料，直到第壹次世界大戰（1914年8月—1918年11月）爆發。
1910年，病中偶然翻閱世界地圖，產生了大陸漂移假說的想法。
1912年6月在法蘭克福地質協會上提出了大陸漂移假說理論。
1912年參加科赫-格林貝格探險隊（該探險隊資料不明），橫貫格陵蘭大冰蓋。科赫是極地冰川初期的研究代表。探險歷時半年。
1913年與柯本（氣候學家）之女埃爾斯結婚。
1915年出版《海陸的起源》。
1919年聘為漢堡大學教授。
1924年聘為格拉茨大學教授。
1928年計劃與科赫再次進行格陵蘭探險，但科赫於當年去世。
1929年，與約翰尼斯 喬治、佛裏斯 羅伊、爾斯特 索爾格壹起進行第三次格陵蘭探險，建立考察站。
1930年4月1日，乘坐“旗魚號”前往格陵蘭島，1930年10月30日到達愛斯米特營地，運送物資。
1930年11月1日在營地度過50歲生日後返回地基，途中遇難。
1931年5月，魏格納哥哥庫爾特（漢堡大學教授）發現魏格納遺體。