毛細管凝膠電泳(capillary gel electrophoresis, CGE)是以起“分子篩”作用的凝膠作為支持介質的區帶電泳,是按照試樣中各個組分相對分子質量的大小進行分離的方法。
毛細管等電聚焦(capillary isoelectric focusing, CIEF)是基於不同蛋白質或多肽之間等電點的差異進行分離的電泳技術。蛋白質分子是典型的兩性電解質,所帶電荷與溶液pH有關,在酸性溶液中帶正電荷,在堿性溶液中帶負電荷。當其表觀電荷數等於零時,溶液的pH稱為蛋白質的等電點(isoelectric point, pI)。不同蛋白質的等電點不同,當向毛細管內的兩性電解質載體兩端施加直流電壓時,將建立壹個由陽極到陰極逐步升高的pH梯度。因此,不同等電點的蛋白質在電場作用下遷移至毛細管內pH等於其等電點的位置,形成壹個窄的聚焦區帶而得到分離。
親和毛細管電泳(affinity capillary electrophoresis, ACE)是利用配體與受體之間存在特異性相互作用,可以形成具有不同質荷比的配合物而達到分離目的。通過測定配合物遷移時間與緩沖液中配體濃度之間的關系,可以求算出結合常數。