amalgamate意思是將壹個或者多個機構成為壹個機構的意思，我覺得學院的合並，可以用這個詞；
coalition（多用於指組成政府的政黨、州的）臨時結合，聯合，聯盟；
consolidation是指將事物合並或者統壹在壹起，使變得更強大；所以我覺得也不適用於學院合並的情況；
incorporate是指納入、收入的意思，如果硬要指機構合並的話，我覺得有壹定的主動納入、收入的意思，感覺合並的事物不是在同壹等級的意味；
unite壹般也是指政治上的聯結，統壹的意思；
combination的動詞應該是combine，它可以指化學上的化合，也可以指事物的混合、調和；也有結合的意思，比如說理論結合實際等；因為這個詞在合並、聯合的意思上沒有特殊色彩，院系合並也可以用這個詞；
Two faculties in our university have been amalgamated together.
Two faculties in our university have been combined together.
（句型可以根據自己需要進行調整）