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circRNA研究應用專篇①:“sponge”與“biomarker”

circRNAs(Circular RNAs,環狀RNA分子)是壹類不具有5'末端帽子和3'末端 poly(A) 尾巴、並以***價鍵形成閉合環形結構的非編碼RNA分子,在真核生物中廣泛存在。近年來,circRNA 基金情況呈現增長趨勢,在2020年基金額達到3000萬+(數據摘自:Let?Pub),研究熱度可見。

circleRNA 的研究為何如此火熱?它們在生物體的生長發育過程中、生理生化反應中憑借其獨特的結構發揮著怎樣的作用?別急,circleRNA 研究應用之上篇——sponge+biomarker,我為您傾情奉上,祝您科研壹臂之力!

1、miRNA 分子海綿(sponge)

circRNA 含有大量的 miRNA 結合位點,具有 miRNA 海綿作用,進而間接調控 miRNA 下遊靶基因的表達。

2、生物標誌物(biomarker)

circRNA結構穩定、半衰期長,可在組織和發育階段特異性表達,circRNA不僅存在於組織和細胞中,而且在體液中也有大量存在,可作為生物標誌物。

作用機制:miRNA 海綿

背景:化療耐藥是三陰性乳腺癌(TNBC)臨床治療失敗和預後不良的主要原因。 circRNA 在TNBC 化療耐藥性方面的研究尚為空白。

研究結論:?CircWAC / miR-142 / WWP1形成競爭性內源RNA(ceRNA)網絡,CircWAC通過靶向結合miR-142,上調WWP1並激活TNBC細胞中的PI3K / AKT信號傳導活性進而誘導三陰性乳腺癌的化療耐藥性。

作用機制:miRNA 海綿

背景:CircRNA 的異常表達會導致人類疾病。circRNA 通過特定的 microRNA 來調節基因表達。本研究探討 circMAP3K5(環狀有絲分裂原激活的蛋白激酶5)是否可以充當競爭性結合內源性 microRNA-22-3p(miR-22-3p)海綿並調節新內膜增生。

研究思路:

研究結論:研究確定 circMAP3K5 為 TET2 介導的血管 SMC 分化的主要調控因子。靶向 circMAP3K5 / miR-22-3p / TET2 途徑可能為與內膜增生相關的疾病(包括再動脈粥樣硬化)提供潛在的治療策略。

作用機制:biomarker

背景:目前,血液生物標記物已經被廣泛用於癌癥診斷,但低敏感性和特異性限制了它們在普通人群癌癥篩查中的廣泛應用。目前,研究者正致力於通過微創技術(即液體活檢)獲得新型、高精度的人體體液生物標誌物。近年來,快速發展的高通量轉錄組分析技術已證實許多 circRNA 穩定存在於諸多體液中,包括血漿、血清、外泌體和尿液等。

研究思路:

研究結果:多種腫瘤研究結果證實,circRNA 可作為液體活檢的重要分子標誌物,作者還使用R中的 shinys 包開發了壹個新的、直觀的 web 界面,供用戶探索和分析 circRNA。

作用機制:biomarker

研究背景:

胃癌是世界上最常見的癌癥之壹。由於缺乏特異性癥狀,80%以上的患者確診時已是晚期,死亡率高,因此早期胃癌診斷勢在必行。

研究思路

研究結論:

circPTPN22 可以作為壹種有效的胃癌診斷和預後生物標誌物,circPTPN22 表達下調,可通過影響EMT途徑抑制胃癌細胞的增殖和轉移,該研究成果提示,circPEPN22 可能通過 ceRNA 機制影響胃癌的進展。

參考文獻:

1、?Wang L , Zhou Y , Jiang L , et al. CircWAC induces chemotherapeutic resistance in triple-negative breast cancer by targeting miR-142, upregulating WWP1 and activating the PI3K/AKT pathway[J]. Molecular Cancer, 2021, 20(1).

2、Zeng Z , Xia L , Fan S , et al. Circular RNA CircMAP3K5 Acts as a MicroRNA-22-3p Sponge to Promote Resolution of Intimal Hyperplasia via TET2-Mediated SMC Differentiation[J]. Circulation, 2021, 143(4).

3、Wang S , Zhang K , Tan S , et al. Circular RNAs in body fluids as cancer biomarkers: the new frontier of liquid biopsies[J]. Molecular Cancer, 2021, 20(1).

4、Ma S , Kong S , Gu X , et al. As a biomarker for gastric cancer, circPTPN22 regulates the progression of gastric cancer through the EMT pathway[J]. Cancer Cell International, 2021, 21(1).