壹、本體不同
稻芽為禾本科植物稻的成熟果實經發芽幹燥的炮制加工品；
麥芽為禾本科植物大麥的成熟果實經發芽幹燥的炮制加工品。
二、分布區域不同
稻芽在我國南部和中部地區廣為栽培；
麥芽在全國大部分地區均產。
三、炮制方法不同
麥芽：
1、麥芽：除去雜質。
2、炒麥芽：取凈麥芽，照清炒法炒至棕黃色，放涼，篩去灰屑。
3、焦麥芽：取凈麥芽，照清炒法炒至焦褐色，放涼，篩去灰屑。
稻芽
1、稻芽：除去雜質。
2、炒稻芽：取凈稻芽，按清炒法炒至深黃色。
3、焦稻芽：取凈稻芽，按清炒法炒至焦黃色。
參考資料：
百度百科-麥芽參考資料：
百度百科-稻芽