第136集（來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件）
劇情簡介：柯南的班級轉來了壹個叫灰原哀的女生，而同壹天少年偵探隊也收到了同校俊野幫忙找哥哥的委托，大家壹起去俊野家進行調查，發現了壹張夏目漱石的肖像畫，俊野說曾有壹個黑衣女人很賞識這幅畫，聽到這些，柯南馬上聯想到了黑衣組織，便急忙帶領偵探隊走街串巷的尋找線索，期間，在便利店遇到的壹個使用假錢的男子引起他的註意，於是，壹路尾隨，推理出了這名男子的去向。
擴展資料：
後續——
雖然少年偵探團被發現且命懸壹線，不過幸好柯南及時趕到，大家得以解救，至於這個黑衣女人根本不是組織裏的人。回家的路上，灰原識破柯南的身份並說自己是黑衣組織的人，而阿笠博士現在已經聽到這些，柯南匆忙趕去博士家卻發現博士安然無恙，而這時灰原也回到家，受命繼承父母的研究，開展藥物研制工作。
因為在實驗中觀察到APTX4869會使小白鼠恢復幼年，並在參與組織的調查中註意到工藤家的幼年衣物消失，猜測到工藤新壹未死並恢復幼年。為了使這個“有趣的研究對象”幸存，將新壹在APTX4869使用者記錄上從“不明”改成“死亡”，以打消組織的懷疑。
姐姐宮野明美希望和妹妹能夠壹同脫離組織，而只讓自己為組織做事，但最終被琴酒在10億元搶劫事件後殺害。 因組織壹直沒有給誌保解釋，誌保於是便停止藥物研究以示抗議，最終被關押。