1、加盟商的主體資格
許多特許總部在簽定合同時將加盟者表述為某某公司(特許盟主名稱)某某連鎖店，筆者認為這是不規範的，因為簽定合同時該連鎖店尚未成立，不具有企業資格。故加盟者應表述為個人姓名或法人單位名稱，在合同中述明，允許加盟者在某地開設連鎖店，擬開設的連鎖店名稱為某某公司(特許盟主名稱)某某連鎖店。同時約定擬登記的特許企業性質，如是個體工商戶還是個人獨資企業、合夥企業或有限責任公司。
2、雙方關系的表述
在特許經營合同中應約定：合同雙方為各自獨立核算單位，只屬於許可人和受許人的關系，雙方之間不存在任何***同投資、代理、雇傭、承包關系。同時應約定，加盟者使用的商標、商號、商譽和經營管理技術歸特許盟主所有。
3、知識產權保護條款
在合同中應對商標、專利、專有技術、域名保護作出明確約定。例如，可作如下約定：“甲方是某某商標的合法所有人，特許企業應保證遵守總部管理體系，不得以任何形式和方式擴大商標的使用範圍,不得擅自制作和使用與某某商標相同或相似的標識。未經甲方書面許可,乙方不得以任何方式和名義在其它國家、地區提出與某某(特許企業商標名稱)相同或與之相類似的文字、拼音、圖形或外文名稱的網絡域名或商標的註冊申請。未經甲方書面同意，乙方不得在特許企業以外使用某某商標、經銷某某專用商品或進行有損於甲方名譽的任何活動。”
4、逾期付款違約金約定應合理
有的特許盟主在特許連鎖經營合同中約定，加盟者逾期支付加盟費、權益費等費用的，特許盟主按加盟者逾期付款額每日加收10%的逾期付款違約金(滯納金)。筆者認為不妥，每天10%，十天就翻壹倍，如果逾期幾個月就翻數倍，有可能顯失公平。《中華人民***和國合同法》第114條第2款規定：約定的違約金過分高於造成的損失的，當事人可以請求人民法院或者仲裁機構予以適當減少。那麽約定多少為妥呢，目前沒有明確的法律規定。筆者認為，可參考最高人民法院關於民間借款約定的利息不能超過銀行同期借款利息的四倍的有關司法解釋，可以參照中國人民銀行規定的金融機構計收逾期貸款利息的標準在四倍以下約定逾期付款違約金。如目前人民銀行規定的標準為每日萬分之三，則可約定逾期付款違約金為每日1‰。