《深化農村改革綜合性實施方案》主要內容如下：
農村改革是全面深化改革的重要內容。根據黨中央、國務院的決策部署，農村各項改革正在紮實開展，壹些重要改革事項試點工作正在有序推進。
當前，我國經濟發展進入新常態，新型工業化、信息化、城鎮化、農業現代化持續推進，農村經濟社會深刻變革，農村改革涉及的利益關系更加復雜、目標更加多元、影響因素更加多樣、任務也更加艱巨。
農村改革綜合性強，靠單兵突進難以奏效，必須樹立系統性思維，做好整體謀劃和頂層設計，找準牽壹發而動全身的牛鼻子和主要矛盾，進壹步提高農村改革決策的科學性。
要從總體上把握好農村改革的方向，提出深化農村改革總的目標、大的原則、基本任務、重要路徑，從全局上更好地指導和協調農村各項改革，加強各項改革之間的銜接配套，最大限度釋放改革的綜合效應。
根據中央統壹部署，從提高農村改革的系統性、整體性、協同性出發，特制定深化農村改革綜合性實施方案。
基本原則
1、堅持農村多種所有制經濟***同發展。在堅持土地公有制性質基礎上，加強對農村各種所有制經濟組織和農民家庭合法財產權益的保護，賦予農村各種所有制經濟組織同等的市場主體地位，保證其依法公平參與市場競爭、同等受到法律保護。
2、堅持和完善農村基本經營制度。把握好土地集體所有制和家庭承包經營的關系，現有農村土地承包關系保持穩定並長久不變，落實集體所有權，穩定農戶承包權，放活土地經營權，實行“三權分置”。堅持家庭經營在農業中的基礎性地位，創新農業經營組織方式。
3、堅持社會主義市場經濟改革方向。調整不適應農村社會生產力發展要求的生產關系，健全符合社會主義市場經濟要求的農村經濟體制，充分發揮市場在資源配置中的決定性作用，加強國家對農業的支持保護。
4、堅持保障農民權益。把實現好、維護好、發展好廣大農民的根本利益作為深化農村改革的出發點和落腳點，切實保障農民合法經濟利益，尊重農民民主權利。
5、堅持統籌兼顧。統籌考慮農業和農村發展，統籌考慮城鄉改革發展，統籌考慮公平和效率。
6、堅持循序漸進、試點先行。發揮好基層和群眾首創精神，在把握方向、堅守底線前提下，鼓勵積極探索、大膽創新，允許采取差異性、過渡性的制度和政策安排。認真組織好農村改革試點工作，及時總結可復制、可推廣的經驗。
7、堅持黨對“三農”工作的領導。必須始終把加強黨對“三農”工作的領導作為推進農村改革發展的政治保證，提高依法做好“三農”工作的能力和水平。在中央的統壹領導下，積極穩妥深化農村各項改革。