1、不同程度
消毒：消毒只需要殺滅或去除致病微生物，使其數量減少，不再引起人類疾病。
殺菌：滅菌不僅要求殺滅或消除致病微生物，還要求殺滅或/或消除所有微生物，包括非致病微生物。
2、不同的方法
消毒：消毒處理方法包括紫外線消毒、臭氧消毒、含氯消毒劑、巴氏殺菌等。
殺菌：滅菌處理方法包括物理和化學方法，包括熱滅菌、輻射滅菌、微波滅菌、等離子體滅菌、幹熱滅菌和高壓蒸汽滅菌，化學方法包括醛、烷基化劑等。
3、應用上的差異。
殺菌主要用於醫院對進入人體無菌組織器官的醫療用品和工業產品的處理。
消毒用於日常生活和工作場所，也用於醫院壹般場所和物品的處理。
百度百科-消毒
百度百科-殺菌
·