自考本科畢業證和本科畢業證的區別體現在畢業蓋章方面。
自考畢業證書上有自考的字樣，而普通高等學校的沒有自考兩個字。自考畢業證上有省自考和所報院校的章沒有校長的章，普通高等學校本科畢業證上有院校和校長的章。自考畢業證書上沒有年制限制，普通高等學校本科畢業證上有年制顯示。
自考畢業證書是由主考高校與高等教育自學考試委員會聯合頒發，而統招本科則是由高校單獨頒發。自考本科畢業證屬於國民教育系列畢業證書，國家承認學歷，電子註冊。自考畢業證書獲得者的待遇與普通高等學校同類畢業生相同，可用於求職工作，考研，考公務員，參加職稱評定等。
自考學歷和普通本科的最主要的區別大概就是壹個是成人學歷，另壹個是全日制統招學歷。學籍類型不同。全日制本科是有學籍的，自考本科是自學考試，是沒有學籍的。
普通本科只是順應學生成長的過程，從高中過度到大學的壹種教育形式，對象是通過高考統考，並取得合格成績的高中生。而自考本科的對象主要是面向社會人士，旨在為更多的人創造學習的環境，讓更多在職者可以有機會提升自身學歷水平，為社會的發展做出壹定的貢獻。