縱觀雲南歷史，會發現這幾年雲南三年連旱並不是壹件偶然事件，而是從明清開始，旱災逐年增多，特別是到二十壹世紀初，旱災呈現加速度增長，最終釀成了史無前例的三年連旱。
1.1 古代雲南氣候 歷史上雲南氣候溫和濕潤，雲貴高原大部分地區年均降雨量在1 100mm左右，雨量充沛，“不乏泉流，雨水滋多”[2]，滇南則屬熱帶雨林氣候，氣候更為潮濕。雲南的土壤主要為赤紅壤和山地紅壤，是因為地處溫暖濕潤的環境，風化淋溶強烈，鐵的遊離度較高，使得土壤呈現紅色[3]。雖然每年有明顯的雨季與幹季之分，但很少出現嚴重的旱災。東漢末年曾經有全國性的大規模旱災，但並無益州(雲貴川)受災的記錄[4]。
1.2 雲南14世紀以來旱災的發展
雲南出現明顯旱災始於明清，從《雲南14世紀以來水旱災害頻次表（頻度：年∕次）[4]（P25-29）》（表中災害數據截止於1990年。）表中可以看出14世紀以來水旱災害發生次數遞增，水災從百年的7次發展到57次，旱災由15次發展到61次,其中旱災每百年發生的次數為14世紀15次，15世紀15次，16世紀24次，17世紀32次，18世紀29次，19世紀35次，20世紀截至1990年61次；水旱災害發生的頻度由4.55年壹次發展到0.77年壹次，“發生水旱災害最多的是20世紀”。隨著時間的推移，災害發生的次數與日俱增，其頻度也呈趨頻態勢[1]。
從雲南有氣象記錄的1961年以來，雲南的年降水量則出現減少的趨勢，半個世紀以來年降水量減少了39mm，減少速率為-8mm/10a，其中夏季和秋季減少趨勢明顯於春季和冬季。最顯著的例子 是西雙版納年降水日由20世紀50年代的每年270天銳減到目前的150天；年霧日由180天減少到30天，以往濕潤的熱帶雨林氣候已經發生明顯變化[5]。
進入二十壹世紀，雲南旱災愈加頻繁和嚴重：
2001年：遇接近於歷史上“最嚴重的旱災”。
2005年：遭遇近50年來最大幹旱。
2006年：遭遇20年來最嚴重旱情。
2009年：遭遇50年壹遇嚴重旱情。
2010年：百年壹遇大旱炙烤雲南。
2011年: 雲南遭遇局部持續幹旱 25縣降水破歷史最少記錄。
2012年: 雲南旱情旱情持續加重。
2 原因分析:是什麽造成了雲南旱災？
2.1大氣環流異常？引起大氣回流異常的主要原因是厄爾尼諾現象，又稱厄爾尼諾海流，是太平洋赤道帶大範圍內海洋和大氣相互作用後失去平衡而產生的壹種氣候異常現象，壹般每2—7年出現壹次，厄爾尼諾的全過程分為發生期、發展期、維持期和衰減期，歷時壹般壹年左右，使風向和洋流發生逆轉。所以不能解釋雲南旱災逐年增強的現象。更不能解釋三年連旱，因為厄爾尼諾現象不可能三年連續出現。
2.2水利設施基礎薄弱？從歷史角度來看：明清以來雲南旱災的日益增長，正好與明清以來日益增長的水利設施建設日益增長成正比，很顯然，水利設施基礎薄弱並不是造成旱災的原因，恰恰相反，水利設施越多的年代旱災反而越多。此外現在抗旱大力開發利用地下水也不是壹個長久之計。過度超采還會導致地下水位持續下降，地表幹旱沙化。壹旦地下水開采完，土地荒漠化嚴重，壹切就晚了[6]。
2.3全球變暖？數據顯示：從雲南有氣象記錄的1961以來，雲南年平均氣溫呈不斷上升的趨勢，截至2010年，49年中雲南年平均氣溫上升了0.74℃，其中年升溫率為0.015℃/年[5]。雖然有壹定的聯系，但從歷史來看，例如侏羅紀時期氣溫則是高於今日約攝氏3°，然而侏羅紀時期卻是地球歷史上最濕潤的時期之壹[7]。所以，全球變暖不是導致雲南幹旱的主要原因。
2.4特殊的地理位置和復雜的地質構造影響？雲南地處於北回歸線附副熱帶高氣壓帶，在北回歸線所貫串之處，大都是茫茫的荒漠：北非的撒哈拉大沙漠、阿拉伯半島的魯蔔哈利沙漠、小內天特沙漠，印度半島的塔爾沙漠……，這種特殊的地理位置也許說明了雲南氣候註定是幹旱的，但是古時候的雲南卻以溫暖濕潤氣候為著名，只是近百年特別是最近十年來才逐漸轉為幹旱，是什麽導致了雲南氣候的巨變呢？
2.5森林覆蓋率？ 雲南歷史上森林覆蓋率極高，宋以前滇西北為70%,滇南為90％，明清以來。森林覆蓋率緩慢下降，但清代中期之前仍然有70%左右[1]，到1935年森林覆蓋率下降到50%，本世紀50年代初的47%，70年代的24%[8]。顯而易見，歷史上雲南旱災的逐年增多和森林覆蓋率逐年降低明顯有關，森林覆蓋率越低，旱災越多。氣候幹旱不是原因，是結果，因為沒有植被，白天地表溫度急劇上升，空氣向上升騰，雲和潮濕空氣無法進入，被卷出該地區[9]。
但改革開放後官方公布的森林覆蓋率數字是從2005年的40.8%增加到2010年的47.5%[10],2009年恢復到49.9%，2012年壹月竟然稱達到52.93%[11]，(其中也有2003年開始的森林覆蓋率計算標準的變化導致的覆蓋率數字虛報[12]。官方公布覆蓋率52.93%，學者發現谷歌地圖顯示不到30%[12]）。但是旱災卻依然逐年增多，甚至加速度增長日趨頻繁和嚴重，由此得出的結論是改革開發後旱災隨著森林覆蓋率迅速增高而迅速增多？
那麽，新增加的是些什麽林呢？2000年以來，西雙版納州新造橡膠林達300萬畝，橡膠林面積從1988年的116萬畝增加到615萬畝。在與緬甸、老撾接壤的瀾滄江沿岸，中國壹側的原始森林幾乎消失殆盡，不管條件優劣都種上了橡膠樹或其他壹些經濟林木。《中國科學報》在2012年2月名為《橡膠林種下的危機》報道中提到：如今，占據中國橡膠種植半壁江山的西雙版納，許多村寨已出現自來水斷流、井水幹涸現象。”中科院西雙版納熱帶植物園的學者表示，研究西雙版納徑流數據發現，即使在降雨量非常低的年份，熱帶雨林中尚有明顯持續的地表徑流，而橡膠林中卻頻繁出現斷流現象[13]。金光集團APP（中國）公司於2002年9月進入雲南省，規劃引種2750萬畝以案樹為主的速生豐產林，建設雲南有史以來最大的林產業工程———林漿紙壹體化項目[14]。林學界學者們早已達成***識：人工純林容易導致水土流失、病蟲害加劇、生物多樣性消失和森林火災增多等壹系列問題，在雲南大面積種植人工案樹林，令科學家們憂慮[15]。
其實，橡膠樹和案樹在原產地自然森林裏對生態並無危害，正真造成水土流失的是為了種橡膠樹林和案樹林等人工經濟林時而把山地原生樹林采伐殆盡，並“將林地中的雜灌木、雜草、蕨類等全部砍除，整地施肥，采用化學除草劑 ”徹底除去地表的植被[16]，甚至“煉山”（煉山就是人為控制的火燒,是人們為了植樹造林在采伐跡地或宜林地上用火燒來清理林地的壹種營林措施[17]），把所在區域天然山林生態系統破壞殆盡，地表植被的鏟除和整地翻土又造成嚴重的水土流失[18]。由於“土地較為貧瘠的地方就不適宜種案樹[20]”，在森林早已破壞殆盡的荒山由於長時間的水土流失，貧瘠、土壤層薄，在這些無林荒山種植案樹等經濟林生長緩慢經濟效益低，所以投資者把魔掌伸向了有林地，提出所謂“中低產林改造[21]”，其實就是把所謂經濟效益低的原始次生林等物種豐富的自然山地植被鏟殆盡[16]，改為物種單壹的案樹、橡膠、核桃等速生豐產林和經濟林，,這種借口所謂的“植樹造林”以及“中低產林改造”對山地原生生態系統的破壞甚至比單純砍伐天然林更為惡劣，砍伐天然林後還保留灌木草本和喬木幼苗，只要保護好封山育林天然次生林還是能逐步恢復的，而種植速生豐產林卻把區域所有天然森林物種趕盡殺絕[16][17][18]！若幹年後再輪番砍伐把地力消耗殆盡，成為真正的荒山。加劇了本世紀雲南更為嚴重的水土流失，生態惡化。是近年來雲南旱災越演越烈的原因之壹，迅速增加的人工林面積和“中低產林改造”面積其實大部分就是對雲南山地天然林生態系統徹底破壞的面積，所以這正是近年來雲南“森林覆蓋率”快速增長，旱災也快速增長的原因。
中國科學院解焱博士介紹，之所以稱人工純林為“綠色沙漠”，壹是因為這樣的樹林中植物種類極為單壹，無法給大多數動物提供食物或適宜的棲息環境，因而林中動物十分稀少；二是這樣的樹林地表植被很差，保持水的能力很差，幹燥且易形成火災；三是這樣的樹林生物多樣性水平極低，因而生態十分脆弱，缺少天敵對蟲害進行控制，很易感染蟲災，造成大面積損害。 植樹造林曾經成為我國森林砍伐的精神寄托和借口，所謂“砍壹棵造十棵”，實際上在壹定程度上造成了我國森林資源的巨大破壞和退化。植樹造林反映了我國自然資源管理存在的嚴重問題，比如管理部門既是管理者又是最大受益者[22]。
實際上，天然原始森林及原始次森林面積卻在不斷縮小，雲南的原始森林除了壹些人跡罕至的險陡山林和保護區，砍得已經差不多了，現達到歷史最低值，當前雲南的全部現存原始森林可能最多也不過三萬平方公裏！即還不到雲南省總面積8%[23]！和旱災增長的趨勢正好成反比，說明了旱災增加的更本原因是原始森林被砍伐殆盡。
原中國科學院龍勇誠教授報道：“2010年3月下旬的壹天，我穿行在雲南哀牢山間的原始森林裏。哀牢山是中國西南地區最為重要的原始森林區之壹。當時正值中國西南地區遭遇世紀大旱期間。然而走進森林中，我眼前卻是壹幅截然不同的景象：山澗潺潺流水，林中猿聲回蕩，鶯歌燕舞，百花爭艷，處處生機盎然。旱情何在？真有百年壹遇的旱災？同在壹片藍天下，同樣數月未見滴雨，哀牢山與災區之間為何會有這麽大的反差？”此後，他們對西南5省的130多萬平方公裏地域進行分析，經過半年多的努力，研究結果表明：自然保護區面積百分比在每個單元格中越高，旱災地點數量就越少。當自然保護區面積百分比達到20%時，旱災地點幾乎為零[24]。
原始森林（就是所謂過熟林）是地球上最重要的生態系統之壹。原始森林維護著自然環境，通過對降雨和蒸發的控制調節天氣，並維持著地球的生態平衡[25]。森林會大量釋放凝結核（離子，特別是負離子）到空中產生雲（空中有很多水汽，只有附在凝結核上的水汽才能成為我們看得見的水汽雲）才能在重力（水汽附在凝結核越來越多）和遇冷就會降雨。森林植被上空接近海洋上空的濕度，特別是當沿海森林植被很好（50%以上）及水汽輸送沿途有足夠的森林（30%以上）他很容易把海洋水汽大量輸送到內陸深處等沙漠地帶！原始森林不僅僅是高大的樹木，而是壹個綜合的生態系統，包動植物間的食物鏈關系，在原始森林中，某壹物種的減少，可以影響其他物種的生存，這種情況在熱帶雨林中體現更為突出。人們在破壞原始森林以後，即使人工補種了大量的樹林，也無法彌補森林被壞對生態帶來的影響的[26]。另壹方面，原始森林下有厚厚的腐殖層和土壤層，但下大雨時腐殖層如海綿般就把大量雨水吸收，再緩慢滲入土壤和地下成為地下水，旱季時水緩慢釋放，防洪抗旱能力極強。
這壹類型生態系統的脆弱環節在於必須保持物種高度多樣化的水平，即使不將叢林砍伐，或降低其生物多樣性水平，或降低藤蔓植物和棕櫚科植物的數量，都會導致叢林因缺水而枯死，誘發局部地區的生態退變。
原始森林被砍伐後，先是腐殖層較容易被風吹和雨水沖刷逐漸消失，保水能力變弱，如果進壹步為了種農作物和經濟林，則把剩下的灌木及草本清除幹凈，“通過深挖墾復，挖除壹切雜灌樹蔸，抑制雜草的生長[18]”，使土壤裸露，進壹步加速水土流失，土壤層不斷變薄，逐漸石漠化，保水能力越來越差最終徹底喪失。形成有雨即洪災，無雨即旱災的悲劇。
雲南是全國巖溶地區石漠化危害程度最深的省區之壹。石漠化的形成往往經歷三個階段：毀林開荒——水土流失——巖石裸露即石漠化，其中不合理的人類活動是導致石漠化的主要誘因。西南地區石漠化土地如不及時治理，按照現在的推進速度，其規模在25年內還將翻壹番。雲南省水土流失面積已達14萬多平方公裏，占全省土地總面積的37％，每年流失土壤5億多噸。中國工程院分析認為，在我國石漠化現象最嚴重的貴州、雲南、廣西三省區，按照現在的推進速度，其規模在25年內還將翻壹番，百年之內若不及時治理，將有壹半國土面積成為石漠化[27]。