國家科技重大專項***有16個，實施時間為2006-2020年，每個投資數百億元，目前公布了13個，具體如下： 國家科技重大專項核心電子器件、高端通用芯片及基礎軟件產品（簡稱核高基專項）是《國家中長期科學和技術發展規劃綱要（2006-2020年）》所確定的國家十六個科技重大專項之壹。科技部是核高基重大專項的領導小組組長單位；工業和信息化部是核高基重大專項的牽頭組織單位，是實施核高基重大專項的責任主體。核高基重大專項實施方案經專家委員會論證，於2008年4月經國務院常務會議審議並原則通過，現已正式進入實施階段。
核高基重大專項的主要目標是：在芯片、軟件和電子器件領域，追趕國際技術和產業的迅速發展。通過持續創新，攻克壹批關鍵技術、研發壹批戰略核心產品。通過核高基重大專項的實施，到2020年，我國在高端通用芯片、基礎軟件和核心電子器件領域基本形成具有國際競爭力的高新技術研發與創新體系，並在全球電子信息技術與產業發展中發揮重要作用；我國信息技術創新與發展環境得到大幅優化，擁有壹支國際化的、高層次的人才隊伍，形成比較完善的自主創新體系，為我國進入創新型國家行列做出重大貢獻。
核高基重大專項所涵蓋的三個方向是21世紀電子信息產業國際競爭的制高點，是體現強國地位的重要標誌。實施好核高基重大專項對提升我國電子信息產業核心競爭力至關重要。而且核高基重大專項與人民生活水平的不斷提高有著密切的關聯，對行業的發展起著重大的支撐作用。這些關鍵技術和產品的突破，不僅將產生可觀的經濟效益，也能增加財政收入，創造更多的就業機會，促進社會的和諧發展。
實施核高基重大專項是我國中長期科技發展規劃中壹項長期而艱巨的戰略任務。國家將充分發揮中央和地方政府、企業、科研院所和高等院校的積極性，建立能夠調動各方面資源的高效組織管理架構，形成職責清晰、分工合理、相互支持、通心協力的管理機制，從而凝聚全國優勢科技資源，做好核高基重大專項實施工作。
核高基重大專項的實施，將設立專門的領導小組、組織實施機構和相應的支撐服務體系，並根據核高基重大專項任務的不同性質和內容，選擇有針對性的組織實施模式。堅持企業為主體、市場為導向、產學研用結合的原則，調動企業的積極性，發揮科研機構和高等院校的優勢，鼓勵應用單位參與重大專項，促進科技成果和產業化的銜接。為保證核高基重大專項的順利實施和目標任務的圓滿完成，實施中將通過制定科學合理、切實可行的過程管理規定和流程，強化過程管理。
在經費投入方面，將在中央重大專項資金支持的基礎上，積極鼓勵和采取有效的措施，促進多元化和多渠道投融資機制的建立，積極引導和促進地方政府、企業、金融機構以及社會資金的投入，同時加強對經費的使用監督，保證核高基重大專項的順利實施。
“十二五”期間，核高基重大專項以滿足國家信息產業發展重大需求的戰略性基礎產品為重點，突破高端通用芯片和基礎軟件關鍵技術，研發自主可控的國產中央處理器（CPU）、操作系統和軟件平臺、新型移動智能終端、高效能嵌入式中央處理器、系統芯片（SOC）和網絡化軟件，實現產業化和批量應用，初步形成自主核心電子器件產品保障體系。 轉基因生物新品種培育專項（簡稱”轉基因專項“）的目標，是要獲得壹批具有重要應用價值和自主知識產權的基因，培育壹批抗病蟲、抗逆、優質、高產、高效的重大轉基因生物新品種，提高農業轉基因生物研究和產業化整體水平，為我國農業可持續發展提供強有力的科技支撐。實施轉基因生物新品種培育重大專項，對於增強農業科技自主創新能力，提升我國生物育種水平，促進農業增效和農民增收，提高我國農業國際競爭力，具有重大戰略意義。
“十二五”期間，轉基因專項針對保障食物安全和發展生物育種產業的戰略需要，圍繞主要農作物和家畜生產，突破基因克隆與功能驗證、規模化轉基因、生物安全等關鍵技術，完善轉基因生物培育和安全評價體系，獲得壹批具有重要應用價值和自主知識產權的功能基因，培育壹批抗病蟲、抗逆、優質、高產、高效的重大轉基因新品種，實現新型轉基因棉花、優質玉米等新品種產業化，整體提升我國生物育種水平，增強農業科技自主創新能力，促進農業增效農民增收。 載人航天與探月工程專項“十壹五”期間重點實施的內容和目標分別是：突破航天員出艙活動以及空間飛行器交會對接等重大技術，建立具有壹定應用規模的短期有人照料、長期在軌自主飛行的空間實驗室。探月工程從繞月探測起步，研制月球探測衛星，突破月球探測的關鍵技術，為全面開展探月工程奠定基礎。