前者采用的是STM步進式對焦馬達，首次發布出現在650D套頭中，屬於近代較新的對焦技術，特點是對焦動作柔和平滑，並且無聲。不同於其它對焦馬達迅猛的突動突停，STM更適用於視頻拍攝時的跟焦應用。
STM對焦系統分為導螺桿型與齒輪型。
導螺桿型STM常用於體形稍長的鏡頭中（比如18-55、15-135STM這類），對焦是無聲的；
齒輪型STM常用於體形稍小的鏡頭（比如50/1.8、40/2.8STM這類），對焦時會有輕微齒輪聲，但不影響視頻錄制。
後者采用的是USM超聲波對焦馬達，佳能大部分鏡頭都采用此對焦系統，特點是對焦迅速並且無聲。
USM對焦系統分為環形、微型、NANO三種。
環形USM系統常用於體形較大的鏡頭中（全畫幅鏡頭基本都采用此系統），特點是扭矩大。
微型USM系統常用於體形較小並且成本較低的鏡頭中，特點是在實現高速和無聲的同時還能降低成本，但扭矩不如環形USM。
NANOUSM系統是首次應用在C幅機80D套頭上的新對焦系統，其綜合了STM系統的平滑無聲和傳統USM系統的迅速特點，在兼顧拍照對焦性能的同時還大幅提升了視頻拍攝追焦的實用性。
另外，佳能早期部分鏡頭采用的是DC對焦系統（比如18-55、18-200IS這類），對焦速度還算迅速，但噪聲較大，並且突動突停，不利於視頻跟焦拍攝。