立校始,提出“博學而篤誌,切問而近思”校訓,倡導“服務、犧牲、團結”、“學術獨立,思想自由”精神,嚴謹治校,壹以貫之。在傳承復旦思想本源的基礎上,學校銳意改革、創新和進取。90年代初期,學校制定了“清、熟、活”的教學目標與要求,實施了有切實效果的教學常規和學習常規。90年代後期至新世紀初,“發展性教育”、“歷史名校可持續發展”、“聚焦課堂教學 提升生命智慧”等課題的思考和實踐,引領全校師生面對時代變革,全面提升修習素養和綜合能力。近年來,學校以文化立校、自強育人思想為指導,既重內涵發展,又重外延拓展,正努力辦成具有獨特個性,有自身文化品格和文化精神的實驗性、示範性高級中學。
復旦中學是上海市文明學校、上海市行為規範示範學校、“聯合國ESD項目實驗學校”、“上海市TI數理技術實驗學校”、“上海市知識產權試點學校”、 “上海市科技教育特色學校”、“上海市體育傳統教育學校”、“上海市攝影特色學校”、區“雙語教學實驗學校”、區“藝術教育特色學校”等。