物理化學性質角度；因為PEG的親水性，可以改善多肽整體的親疏水性質，小分子PEG可以做為Link,把修飾基團和多肽結合起來，有時候要比6-氨基己酸更有優勢。常見的是Biotin-PEG4-Peptide。
PEG4的結構如下：
接下來，我將詳細介紹下多肽的PEG修飾。
小分子PEG修飾。分子量區間在PEG2-PEG24之間。如
AEA ? 5-amino-3-oxapentanoic acid
AEEA 8-Amino-3,6-Dioxaoctanoic Acid? 9 atoms （mini-PEG）
TTDS 1,13-diamino-4,7,10-trioxatridecan-succinamic acid
Ebes ? 8 - amino - 3,6 - dioxa - octyl)succinamic acid （PEG2-Suc-OH）?
AEEEA ? 11-Amino-3,6,9-Trioxaundecanoic Acid? 11 atoms（mini-PEG3）
dPEG(4) ? 15-amino-4,7,10,13-tetraoxa-pentadecanoic acid
dPEG(8) ? alpha-amino-omega-carboxy octa(ethylene glycol)
dPEG(12) ? alpha-amino-omega-carboxy dodeca(ethylene glycol)
這類小分子PEG就相當於特殊的氨基酸，修飾步驟和合成氨基酸的步驟壹樣。
例如我們在多肽中插入AEEA，
那麽所使用的原料壹般為Fmoc-AEEA-OH，（CAS:166108-71-0)
大分子PEG的修飾，分子量區間在PEG500-PEG40K之間。例如PEG2000和PEG5000的修飾。具體以PEG2000為例。
常見的PEG2000的修飾位點為
1：多肽的N端，如PEG2000-DTGLIWAPQNT-OH。
2：氨基酸Lys的側鏈H2N-DTGLIW-K（PEG2000）-APQNT-OH
3：Cys的側鏈，如H2N-Cys(Mal-PEG2000)-DTGLIWAPQNT-OH,通過巰基和Mal結合來把PEG2000修飾在多肽上。
特殊的PEG2000修飾位點
1：在多肽中間，如H2N-DTGLIW-PEG2000-APQNT-OH，因為通過固相合成，PEG2000很難連接到H2N-APQNT-Resin上，我們之前做過大量固相合成實驗，反應速率慢，收率低，使用PEG2000原料也比較多，所以通常我們采用液相分段合成，這樣可以節約很多的PEG2000原料。是個產品在市場上更有優勢。
2: 在多肽C端，如H2N-DTGLIWAPQNT-PEG2000，這個比在中間的要簡單很多。
PEG2000其實是壹個混合物，因為其n值在壹個範圍內，例如n=40、41、42…45…46、47等。我們可以通過下面Tof圖譜看出PEG2000的峰型，是壹簇比較集中的峰。