1代：萊肯市郊外的阿萊克郊區發生神秘的殺人事件，R.P.D派遣S.T.A.R.T.S前往該地區進行調查，在主角的小隊到達之前已經派遣了幾個小隊前往該地，但是最後失去聯系，主角小隊除了調查殺人事件之外還要搜尋其他隊員的下落。在調查期間遭到B.O.W喪犬襲擊，被迫逃跑，之後躲到了壹間洋館之中。根據遊戲所選人物不同，遊戲開場後出場人物也不同。期間在洋館中遭遇各種B.O.W襲擊，通過調查和在其他幸存者口中得知此處是Umbrella的生化武器研究所，洋館只是個掩飾物，由於病毒泄露才引發的整個事件。事情敗露之後威斯克宣稱因為S.T.A.R.S都是經過訓練的特種作戰人員，引他們到此就是為了檢驗B.O.W的作戰性能並回收數據，但他最後被自己喚醒的Tyrant殺死。之後洋館自爆系統啟動，主要幸存者在爆炸之前坐直升機逃跑。
2代：洋館事件1個月之後，女大學生克雷爾來到萊肯市找她的哥哥克裏斯，也就是1代的男主角。同時，第壹天來R.P.D報到的菜鳥cop裏昂也驅車來到萊肯市，雙方在同壹時間不同地點遭遇到已經喪屍化的市民襲擊，然後命運般的相遇。之後驅車趕往R.P.D商量對策，此間克雷爾得知克裏斯已於壹月前前往Umbrella歐洲總部調查取證。在尋找不到其他幸存者之後二人決定逃離此地，並用對講機保持聯絡，在警.局克雷爾遇到了G的女兒雪莉，裏昂遇到了讓他糾結了很多年的前來“尋找男友”的艾達，從把自己反鎖在監獄裏的本恩那裏得知市民喪屍化的禍首就是Umbrella，局長受賄對他們睜壹只眼閉壹只眼，局長最後被G撕成了兩節，但是下半截不知所蹤，呵呵。克雷爾從雪莉的母親口裏得知，她的丈夫威廉為了保護自己的研究成果G將其註射到自己體內，從而變成怪物，老鼠在舔舐了灑在地上的T病毒液體並將其帶到了地面從而感染市民。因為要尋找基因相似的活物進行繁殖，所以G壹直在尋找雪莉。Umbrella也放出了第二代Tyrant，為其穿上了防止暴走的綠色大衣，在腦部植入微機進行控制，主要目的是尋找G病毒樣本。在到達地下的的研究所之後，不同玩法有不同劇情，或是艾達被G感染，或是雪莉被感染，裏昂在威廉的妻子阿奈特死亡之後取得G病毒樣本，並得知艾達是間諜的真相，因為在短時間內愛上裏昂的原因，艾達並沒有勇氣殺了裏昂奪取樣本，但卻被未知槍手槍擊從高處墜落，裏昂也把G樣本扔了。雪莉的項鏈裏也有壹個G樣本，被克雷爾扔到溶解B.O.W溶解池中，Tyrant也跳了進去，防暴走大衣被燒毀，暴走形態暴露。完事之後在緊急用火車站被暴走Tyrant襲擊，不管誰的劇情都會出現艾達模糊的身影扔下火箭筒，之後再火車上遇到窮追不舍已經進化到巨大化的威廉襲擊，火車電腦在檢測到感染物存在之後啟動自爆系統，G被消滅。克雷爾裏昂雪莉成功逃生，然後克雷爾發誓要找到克裏斯，3代的劇透裏裏昂和雪莉被FBI控制，而且FBI很欣賞裏昂的能力。雪莉不知所蹤。死神漢克拿到了G病毒樣本。
3代：3代在劇情上發生在2代之前。洋館事件發生後，沒人相信克裏斯吉爾巴裏等人的調查結果，因為有局長從中作梗，萊肯市的市民大部分被感染，於是吉爾在孤立無援的情況下決定逃出去，在RPD調查時遇到1代開直升機的駕駛員，被Umbrella的新型Tyrant產品“Nemesis”襲擊致死。在逃亡過程中遇到了被欺騙的雇傭兵卡洛斯 彌漢爾 尼克拉，於是幾人決定前往雇傭兵們在任務結束後的匯合逃亡點時鐘塔，途中彌漢爾試圖與Nemesis同歸於盡但是失敗。到達地點之後又因被Nemesis把撤離用直升機打爆計劃失敗，吉爾也被Nemesis病毒感染，在卡洛斯的幫助下取得抗體疫苗，在醫院內得知尼克拉別有用心。之後二人決定前往廢物處理廠另尋辦法，吉爾調查到Nemesis的任務是通過消滅STARS殘余人員收集實戰資料也是殺人滅口。在此卡洛斯得知軍方在天亮之後將發射核彈來毀滅病毒。在殺死暴走的Nemesis之後二人做直升機逃離，根據路線不同劇情也不同。
正統的生化3應為 生化危機：代號 維羅妮卡
4代：已經成為骨幹探員的Leon來到歐洲的壹個小村落來調查被綁架的總統女兒下落，期間被狂暴的村民襲擊，發現另有隱情。最後調查得知所有村民都被光明.教註入了壹種古老的寄生蟲加以控制，壹個名叫路易斯的研究員參與了寄生蟲的各種研究，在拿到樣本之後被主謀殺死。期間Leon遇到了已經“死亡”的戰友克勞澤。威斯克派出艾達來尋找樣本，通過誘騙路易斯以此想快速達到目的，暗中也在幫助Leon，死神漢克也在暗中行動。就出總統女兒之後再調查中得知光明.教想給總統女兒註射寄生蟲再將其送回國從而慢慢控制美國的長遠目標。殺死最終Boss之後ADA拿到樣本，小島被炸，Leon和總統女兒Ashley坐摩托艇逃跑。
5代：沒什麽可寫的，和4代壹樣已經變得太多了。克裏斯參與了BSAA，來到非洲某地調查BOW，與當地的組織成員莎娃組隊調查，最後得知威斯克在該地區找到了當年用來研究始祖病毒的原料，壹種產自非洲的花，具體叫什麽我忘了。期間解救了被威斯克控制的吉爾。威斯克與某組織組團用始祖病毒T病毒G病毒還有LasPalagas寄生蟲研制出了新病毒，他想把這種寄生蟲病毒用特種制造的飛機撒到全世界，最後被克裏斯和莎娃挫敗，自己掉落在巖漿中，被坐在直升機上的克裏斯和莎娃用RPG打爆了頭，但是他又不像被打死了，給玩家留了個懸念。
大概就是這樣，不全的地方很多很多，歡迎吐槽拍磚！