《虐殺原型2》是繼《虐殺原型1》後的續作，所以很多地方繼承了前作的設定，但是很不幸，本作在繼承設定與發展劇情外，通關後原檔案可玩性卻遠不如前作高。
舉個典型的例子吧：
前作通關後可依然跑來跑去拆基地、炸巢穴，還有很多裏程、提示球可以搜集；
但是本作通關後，在原檔裏面妳再也無法到達巢穴或基地裏面（我把所有任務都做完了，包括巢穴和搜集任務）
哎，悲催啊~ 只能通過“新遊戲+”繼承所有技能的情況下重新開始才能有點新鮮~
至於LZ所說指揮官，我想妳是想問“魯克斯上校”。
上校的去向本作並未告知玩家，但是通過主線最終關倒數第二個戰鬥後的劇情：
魯克斯上校：“帶上妳的女兒，然後和她壹起離開這個該死的城市”
再加上在阿薩爾博士關卡中魯克斯上校說“再過幾周爸爸就回家陪妳（女兒）”
由此我們猜測：魯克斯上校回家了，不會再出現在已經通關後的遊戲，準確的說，是那次對話結束後就離開的身影，便表示魯克斯上校已經離開了“這個該死的城市”。
以上是我玩過遊戲後的回答，希望能幫到妳，祝妳遊戲愉快~