中醫認為，治療疾病不僅要關註癥狀的表面表現，更要從病因開始入手，深入剖析病因，分析病機，尋找根本的治療方法，這就是中醫的治本思想。中醫始終強調整體觀念，不是像現代醫學壹樣只看壹個器官或壹個癥狀，而是要全面分析患者的身體、情況及飲食、生活習慣等全面因素，找到治療的根源，達到根治疾病的目的。
中醫對於疾病的治療強調“以治病之本而不治其末”，始終從病因入手，如失血、過度勞累、情緒壓抑等，都會造成自身免疫能力的下降，而使各種疾病順勢而入。因此，中醫采取養生保健的治療方法，通過調整調節身體的氣血陰陽、調理肝、肺、心、脾、腎等臟腑功能，增強自身免疫力，從而達到治本的效果，減少轉化為疾病的可能。
中醫的治本思想得到了現代醫學的認可，兩種思想體系的結合可以做到隨診隨治、壹體化的治療。比如，中醫藥經中草藥復方、膏方等治療方法，都可以在現代醫學的監測下，通過現代科技手段對其進行檢驗並且輔助治療。在現代醫學中與傳統中醫思想結合的治療方式，可以大大提高治療疾病的效果，讓病人更快獲得健康。