目錄如下：
第1集 光的繼承者
兩頭怪獸的出現打破了和平地球的寂靜，怪獸在日本登陸後，直沖某個地點，那裏有的古代文明的遺跡…..。勝利隊的隊員在與怪獸的戰鬥中，得到了傳說中的巨人迪迦的幫助。
第2集 石頭的神話
在壹座島上，連續發生了人變成石頭的怪事，這壹切都是住在島上的怪獸所為，勝利隊用強化了的威力武裝後，擊退了在島上暴亂的怪獸，但是另外壹頭怪獸出現了。
第3集 惡魔的預言
在勝利隊居間惠隊長的面前，出現了壹位守護地球的外星人，他要求隊長認可他成為人類的保護者。但是隊長深信奧特曼迪迦才是人類的保護者。
第4集 再見了，地球
從宇宙飛來的威猛怪獸，吞食了搭乘著地球人的宇宙飛船。但是，地球駕駛員員並沒有完全失去意識，新城君拼命喚醒同伴們，齊心協力來戰勝怪獸。
第5集 怪獸出沒的日子
北川市沿岸漂著怪獸的屍體，勝利隊開始處理這壹情況，但是怪獸復活了，只有燒毀它才能消滅它，宗方副隊長又再次確立新的戰鬥方案，去迎戰怪獸……
第6集 第二次接觸
奇妙的雲彩接近著地球。勝利隊隊員崛井推測這是否是居住在空中的怪物……當怪獸出現時，他追問到了怪獸的特殊語言，並實現了他恩師的遺願，嘗試著與怪獸交流。
第7集 降臨到地球的外星人
企圖侵略地球的外星人，在接近了地球時，曾遭到這保衛地球的宇宙中心的反擊，外星人對宇宙中心的技術長官懷恨在心,並想誘拐技術長官的女兒，戰勝惡劣外星人成了奧特曼迪迦的神聖使命。
第8集 萬聖節的夜晚
在萬聖節的晚上，勝利隊收到了有異常的信號。立即就此展開了調查。與此同時，隊員在追趕奇怪的魔女時，知道了她就是專門竊取孩子們夢想的“異次元人”魔女，必須戰勝她，才能讓地球的孩子們有壹個夢想的夜晚。
第9集 等待怪獸的少女
在建築工地發現了神秘的密封太空艙。勝利隊的隊員大古和RINA在調查訪問中相遇了壹位少女。在超級能量小隊的本部裏，少女的笛聲解開了密封太空艙的大門，太空艙內，壹匹怪獸出現了。
第10集 被封閉的遊樂園
新城兄妹二人前去遊樂園，在那裏遇到了遭受別人欺負的春樹兄妹，信城鼓勵他們要拿出勇氣來，正在這時，地底下冒出了怪獸，春樹為保護妹妹，與怪獸進行決鬥，最後被及時趕到的奧特曼迪迦所搭救。
第11集 走向黑暗的安魂曲
勝利隊收到了有神奇生物的反應，趕到現場的勝利隊的隊員HORI正巧與大學時代的同學相遇，但是同學的舉止十分古怪，據能量小隊的探測，怪獸正潛伏在友人的體內。捕捉怪物，搭救同學的戰鬥又開始了。
第12集 從深海來的SOS
勝利隊的隊員RINA的寵物海豚，最近總是沒精打采。好象受了驚嚇。就在這時，海底地層連續發生地震，怪獸出現了。海豚出於動物的本能感受到了，為了維持海洋的和平，奧特曼迪迦將挑戰深海怪獸。
第13集 采集人類
市民爭壹在壹個晚上，目擊了外星人用奇怪的光線槍把擄捕地球人的場面，它們想把捕獲的地球人當作外星人奴隸。為了營救被抓獲的爭壹，奧特曼迪迦再戰外星人。
第14集 被流放的目標
勝利隊的隊員大古從神秘的男人手中救下了名叫RUXIYA的少女，少女好象是從其它星球上來的。其實神秘的男人正是外星人，而許多戴手鐲的人和名叫RUXIYA的少女壹樣，是被玩打獵遊戲的外星人所驅放出來的遊戲目標而已。奧特曼迪迦必須去制止這種不道德的遊戲。
第15集 夢幻疾走
怪獸再壹次出現了，市民AYUMI的戀人--拓磨乘坐的客機被怪獸襲擊。超級能量小隊與怪獸進行了苦戰。
第16集 鬼神醒來
在日本，傳說中的壓著鬼的宿那山出現了怪獸，據說是盜墓者誤拿走了封存鬼的劍，宿那鬼便復生了。其實是宇宙粒子能量變化產生了怪獸，超級能量小隊的戰鬥又打響了。
第17集 紅與藍的決戰
近日連續發生了深夜失蹤案件。超級能量小隊在搜查時遇上了正在幫助地球老太婆的外星人。這位外星人告訴超級能量小隊近來不管白天黑夜，都有地球士兵被外星人捉走的情況，這嚴峻的事實引來了保衛地球的奧特曼迪迦。
第18集 哥爾贊的反襲
死火山霧門嶽又噴發了。勝利隊對巖漿的流向發出了疑問，出動了地底戰車前去現場調查。到達地下的大洞時，隊員大古察覺到了導常。對，哥爾贊它又回來了！
第19集 GUTS奔向宇宙(上篇)
突然間，出現了打擊人類的外星機械獸。在太空中做推進系統試驗的超級能量小隊RENA目睹了在宇宙裏有的機械獸的浮島。地球面臨著危機。
第20集 GUTS奔向宇宙(下篇)
奧特曼迪迦從企圖自爆的浮島那裏脫身後，超級能量小隊對機械獸的零件進行了調查，查明了包括機械娃娃和機械島在內的系列事件的幕後者，抓出幕後者，除掉心患，奧特曼迪迦再上征途。
第21集 出場了 德班
具有人類頭腦的的魔神，它的所到之處，都有個叫“愉快夥伴”劇團的出現，超級能量小隊對劇團的明星進行了調查，原來這些明星與魔神有千絲萬縷的關系。
第22集 大霧來了
因與宇宙觀察中心斷絕了聯系，超級能量小隊前去調查，在附近的神奇磁場的影響下，不知為何，村裏沒有了人影。在那裏救出的女性說著語無倫次的話“霧來襲擊我們了”，原來難對付的寄生怪獸作的怪，奧特曼迪迦與寄生怪物展開了激烈的戰鬥。
第23集 恐龍們的星球
有壹天，地球人受到了名叫NAGA的異星人的襲擊，作為地球保衛戰士的恐龍類人類。在得知戰鬥時，自身內臟中的中性子炸彈會使地球上的半數生物至於死地時，它們動搖了……只能再度求救於奧特曼迪迦。
第24集 前進！怪獸探險隊
連續接到北關東的利戶間町發生的怪現象報道。超級能量小隊前去調查。事件的背後好象與怪獸有關，有位少年說聽到了怪獸的聲音，可是這位少年有愛撒謊的毛病，究竟怪獸是否存在呢？
第25集 惡魔的審判
大城市的上空出現了所謂的“天使”，成了人們的話題，但是超級能量小隊的隊員們看到了它的不吉祥影子，原來它是想煽動人們把奧特曼迪迦從地球上除掉。對此，奧特曼迪迦對扮成“天使”的魔鬼進行了正義的審判。
第26集 彩虹般的怪獸魔境
有壹戶人家在開車兜風的回來路上，看到了不可思議的彩虹。當他們穿過彩虹時，再也開回不到住處了。壹家人好象著了魔，到了怪獸的魔境中，誰來解救他們呢？是奧特曼迪迦！
第27集 看見了奧比克
在彥野街的附近正在進行著大規模的開發工程，在工地上，流傳著有看見怪獸的傳聞。到了夜深人靜的時候，怪獸出現了，超級能量小隊也被它的魔力弄得穩不住陣腳，幸好奧特曼迪迦及時現身。
第28集 呼喚……
地球和平中心正在和地球上的怪獸們進行著激戰，可是新的怪獸們仍舊不斷的湧上街頭，地球和平中心下屬的超級能量小隊隊員們都因連續作戰而感到身心疲憊，他們正在考慮著該如何面對這壹現狀..
第29集 藍色夜晚的記憶
隊員信城在壹次試飛中出了事故後，樣子怪怪的，對明星MAYA很固執。實際上，在事故的時候，他的肉體裏已經潛伏了外星人。這個外星人是來接15年前留在地球的妹妹MAYA的……。
第30集 怪獸動物園
大古和RINA利用休假去動物園遊玩，突然間怪獸出現了。GUTS立即出擊，但是，怪獸卻沒有特別亂鬧，為了防止怪獸給大家造成傷害，準備先發制人時，RINA提出反對意見。
第31集 GUTS基地被襲擊
在南極發現的隕石中，寄生著惑星的生物…。GUTS隊員們對其能整治地球環境抱以了幻想，只考慮自身繁殖的生物，為了收集必要的能量，占據了GUTS基地的計算機。
第32集 滋爾達中心的攻防
壹匹怪鳥正向著各類生物封印的某壹處飛去，發明了GAS，並把它封印起來的根津博士說，20年前，因GAS而犧牲的女兒的寵物，變成怪獸出現了。GUTS立即采取了防戰體制。就在這時……
第33集 吸血都市
大城市裏頻頻發生失蹤事件，雜誌記者小野田發現了事件的背景是由魔獸在作怪，並且了解到曾經的同事也是犯人。GUTS將挑戰想支配世界限於黑暗的魔界。
第34集 直達南方海峽
澤井總監乘坐的飛行機斷絕了消息。立即前往搜索的GUTS，在壹個島的上空遭到了某種阻礙。與此同時，根據總監的消息，小島想作為首都誕生新國家。GUTS掌握了誰想利用總監搞陰謀。
第35集 沈睡的少女
襲擊了總監的神奇生體兵器，原來是24年前，來過地球的外星人。RENA壹直遭到它的幻影幹擾，最終還是被它抓去了。異星人企圖利用巨大怪獸改變地球環境。為了救處RENA，迪迦起飛了。
第36集 超越時空的微笑
曾經消失的船舶和飛行機突然之間又出現了。YAZUMI命令調查與其同壹現象出現的少女。原來全是怪獸在操作著，GUTS開始了擊退怪獸的作戰方案……
第37集 花
在和平時期，GUTS都去看花了，大家都沈醉於美麗的櫻花中，開心的忘記了時間。就在這時，留守於本部的大古探察到在看花的主要地點發生了異常變化。
第38集 海市蜃樓的怪獸
街上四處傳播著出現了怪獸的消息。實際上，是TPC的情報部故意傳出的謠言，目的是為了觀察人們的反應。GUTS的隊長知道內情，還是派隊員們調查現場感到很困惑……。但是，怪獸真的存在了……
第39集 拜啟奧特曼
有壹天，大古接到了壹份“我知道，妳的真面目”的電子郵件。發信的人是壹位有超級能力的青年，建議大古參加壹個遊戲。為了具備別人沒有的力量，青年有過痛苦的過去，大古為此力量，也同樣飽受著嫉妒的感觸。
第40集 夢
未知的宇宙線落到地球上後，每天夜裏，人們受到怪獸的幹擾。GUTS對於這種不存在的次元，毫無辦法。這些怪獸好象是通過人類做夢時發出的腦波，由宇宙線出現的。
第41集 從宇宙來的朋友
信城君的2位好友乘坐的宇宙船，不知被誰襲擊了。到達不了目的地。前去救助的信城，把突如其來的怪獸給打倒了。但是，從神奇的生命體中，冒出來的是面目全飛的好朋友，滿腔罪惡感的信城……
第42集 少女消失的街道
有壹天，YASUMI接到巨大遊戲城市的邀請。但是，壹起來的RINA消失了。他也被卷入奇怪的空間進行著戰鬥。這是醒來的遊戲城市的計算機，KAREN開始了地球征服計劃。
第43集 地中的鯊魚
在九州，熊本出現了怪獸，GUTS立即出動了。大古駕駛的勝利1號，顯示了奇怪的反應。神秘的男人對大古說“等妳多時了”。大古為了抵禦怪獸的進攻，變身後……
第44集 影的繼承者
有位呼喚著大古的男子，他具有著變身為奧特曼的遺傳因子。從大古那裏奪取了變身工具的男子，成為迪迦後，想制服怪獸。大古對自己的無力感到非常悔恨，就在這時……
第45集 永遠的生命
有壹天，在地球上，曾經在太古地上開花的植物又出現了。這種植物的花粉有著可怕的幻覺作用。太古的人類成為了它的幻覺俘虜，由此而滅亡。難道又要難逃這壹命運嗎？大古作為壹個普通人將挑戰命運！
第46集 至急！鐮倉
星野壹直在拍電車周圍的風景，發現了從海上有怪獸在接近。但是GUTS經過周密的調查，全然沒有發現怪獸的蹤影。大古RINA相信星野的直感，又壹次奔赴了現場，就在這時……
第47集 告別黑暗
HORI在拍拖時發生的電力異常事故，是細胞被移植後的猴子所造成的。HORI為了解決這壹問題，把研究所裏所有的數據資料都清洗掉了。這時，他又和SAYAKA見面了，SAYAKA也是從悲劇中重新站立起來的。
第48集 月球來的逃亡者
TPC的月面基地全軍覆滅了，唯壹的生存者，證言犯人是HAYATE隊長，曾經是他戰友的IRUMA不能相信這壹事實，IRUMA的提案也遭到總監們的拒絕，誰能想到這是外星人隱藏的陰謀呢……
第49集 奧特之星
大古發現了壹位想買怪獸的奇妙男子。有人介紹他去熟知怪獸的圓古英二導演，之後，他就消失在光影中，追逐著男子的大古，來到了1965年的怪獸特攝節目的圓古制作小組……
第50集 飛得更高 Take me higher
大古經常在夢中看到世界被關閉在黑暗中，這壹噩夢好象是在成為現實，從超古代的遺跡中，出現了怪獸，出擊的GUTS面對怪獸的高速飛行，非常的苦惱，RENA追趕著怪獸，可是……
第51集 黑暗的支配者
世界各地出現了怪獸，壹切都陷於混亂中。超古代遺跡的地底裏，也出現了最強的惡魔怪獸，人類真的將被黑暗籠罩嗎？大古，現在就是顯示光的力量的時候了。
第52集 致以輝煌的人
迪迦失敗了，人們都陷入了極其悲痛之中。GUTS為了挽救迪迦，利用做出了曾經開發的光遺傳子，進行照射的作戰方案……
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