業務流程設計是指根據市場需求與企業要求調整企業流程，包括設計、分析和優化流程。設計階段主要包括兩項任務：其壹，透視現有流程質量；其二，根據當前市場需求調整現有業務流程。對於這兩項任務來說，必須基於壹套統壹的方法和統壹的描述語言。設計階段要解決“何人完成何種具體工作，以何種順序完成工作，可以獲得何種服務支持，以及在流程中采用何種軟件系統”等問題。分析過程中，我們可以掌握流程在組織、結構及技術方面存在的不足，明確潛在的改進領域。設計階段的目的是根據分析結果並結合企業目標制定目標流程，並在IT系統中實施有助於今後為企業創造價值的目標流程。
企業業務流程設計是建立在系統思考分析的邏輯上的，采用系統壹體化方法。美國學者彼得·聖吉在其名著《第五項修煉》壹書中所說的“第五項修煉”就是“系統思考”。企業學會整體運作的思考方式，才能提升組織整體運作的質量。系統分析是為完成組織預定目標對組織所作的總體整合的分析。系統壹體化方法以整個流程為對象，強調的是企業為完成預定目標所做的整體的成功，局部的價值完全由它們提高整體成功的程度而定。換句話說，企業運作壹體化關註的是整體最優，而不是局部最優。
業務流程設計涉及到信息、需求、預測、計劃、采購、生產、倉儲、運輸和交付等的全過程 。業務流程設計的目的是要按盡可能低的成本，最快的速度支持業務活動。以時間為基礎的流程優化，以增值和反應速度為基準。