優點：殺菌濃度較低，壹般使用千分之幾即可；水溶性好，表面活性強，使用方便；溶液無色，不會染汙物品，亦無腐蝕、漂白作用；毒性與刺激性低；氣味較小；性質穩定，耐光，耐熱，耐貯存。
缺點：對部分微生物效果不好，特別是對某些病毒；價格較貴；配伍禁忌較多；殺菌效果受有機物影響較大。
使用季銨鹽消毒劑註意事項
1、外用消毒劑，不得口服。置於兒童不易觸及處。
2、季銨鹽屬陽離子表面活性劑，陰離子表面活性劑如肥皂、洗衣粉等對其消毒效果有影響，應避免與之合用或接觸。不宜與枸櫞酸鹽、碘化物、硝酸鹽高錳酸鹽水楊酸鹽、銀鹽、酒石酸鹽生物堿鋁、熒光素鈉、過氧化氫、白陶土、含水羊毛脂等配伍。
3、易被多孔類物品吸附，浸泡液濃度可隨消毒物品數量的增多而逐漸降低，應視被消毒物品的種類與數量酌情加大使用劑量並及時更換消毒液。
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