壹、兩者的來源不同：
1、人工麝香的來源：人工麝香作為瀕危動物藥材麝香的替代品，等同天然麝香配方使用。?
2、天然麝香的來源：天然麝香來自麝的雄獸腹部下方生長的香腺和香囊中分泌和貯存的壹種外激素或信息化合物。
二、兩者的性狀不同：
1、人工麝香的性狀：棕褐色粉末，顯油性，有光澤。
2、天然麝香的性狀：麝香香囊經幹燥後，割開香囊取出的麝香呈暗褐色粒狀物，品質優質者有時亦析出白色晶體。固態時具有強烈的惡臭，用水或酒精高度稀釋後有獨特的動物香氣。
三、兩者的意義不同：
1、人工麝香的意義：是國家重大科研成果和保密品種，用人工麝香生產中成藥品種近400種，涵蓋中成藥常用劑型。?是珍稀動物藥材代用品研究的重大突破，為其它珍稀動物藥材的應用開辟了壹條重要的新途徑，為其它科研成果推廣創立了可借鑒的模式，促進中醫藥事業可持續健康發展。
2、天然麝香的意義：麝香的香味濃郁，經久不散，對人的心理和生理系統有極其顯著的影響，在香料工業和醫藥工業中都有十分重要的價值。
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