城市軌道交通運營調度應急指揮組織系統包括介紹如下：
(1)行車組織指揮體系
行車組織指揮體系是城市軌道交通系統的核心，通過控制中心行車調度員的實施，實行高度集中，統壹指揮，使各個環節協調運作，保證列車安全、正點運行。
(2)供電指揮體系
在城市軌道交通供電指揮中，控制中心電力調度是主要的調度指揮，它接受本身控制中心主任的直接指揮的同時，還接受地方電力調度的指揮。當地方電力系統有相關信息時，由地方電力調度通知到運營控制中心的電力調度。
(3)應急指揮體系
在軌道交通應急指揮體系中，控制中心的主要職能是信息收發中心，收集和將信息傳達到相關單位及個人。在應急現場壹般會成立現場總指揮，負責現場的搶險救援的指揮工作，同時考慮各方面的需要，相應成立行車客運組織及搶險救援、現場疏導、應急監測、醫療救治、新聞信息等組別，而這些組別通常由軌道交通各專業搶修隊、相關職能部門組成。 2．列車運作有哪幾個環節?
列車運作根據列車每日運用過程，可以分為四個環節：列車出廠、列車正線運營、列車收車、列車場內整備和檢修。
(1)列車場內整備
列車整備在運用庫進行，在每次列車運行前由司機根據有關規定進行列車功能性檢查，司機對司機室照明、儀表指示燈、雨刷、喇叭、停車制動、常用制動、快速制動、緊急制動及車門系統等進行操作檢查。
(2)列車出廠
司機對列車的整備作業完畢，確認是否符合正線服務條件，如符合，則到達規定的出車時間後，報告車廠信號樓值班員整備作業完畢，確認出廠信號開放，駕駛列車出庫，到達轉換軌處壹度停車，待收到速度碼，確認進路信號開放後，進入正線。
(3)列車正線運營
正常情況下，進入正線後的列車按時刻表要求進行運作，執行運輸乘客的任務。司機註意觀察列車顯示屏信息!各種指示燈和儀表顯示，自動開關狀態。運行中不斷了望進路，發現危及行車安全的情況立即采取緊急措施。
(4)列車收車
列車由正線進入車輛段，行調聯系信號樓值班員排列進場進路，司機確認進廠信號機開放後，進入車輛段。列車在停車庫停穩後，司機攜帶列車鑰匙、司機報單及其他相關物品與運轉值班隊長辦理退勤手續。
(5)列車場內檢修
列車回庫停穩並按規定收車後，運轉值班員與車輛維修部門辦理車輛交接手續，由車輛維修部門進行維修作業。維修作業完畢，檢修負責人與運轉值班員辦理車輛交接手續，運轉值班員確認車輛技術狀態符合運營要求後方能接受投入正線使用。