下屬分會
兒童保健分會
婦女保健分會
中華預防醫學會職業病專業委員會
中華預防醫學會微生態學分會
中華預防醫學會衛生事業管理分會
中華預防醫學會衛生統計專業委員會
中華預防醫學會食品衛生分會
中華預防醫學會生物制品分會
中華預防醫學會慢性病預防與控制分會
中華預防醫學會口腔衛生保健專業委員會
中華預防醫學會環境衛生分會
中華預防醫學會衛生防疫管理分會
中華預防醫學會初級衛生保健分會
中華預防醫學會媒介生物學及控制分會
中華預防醫學會流行病學分會
中華預防醫學會勞動衛生與職業病分會
中華預防醫學會醫院感染控制分會
中華預防醫學會兒少衛生分會
中華預防醫學會消毒分會
分支機構
中華預防醫學會總部設在北京，目前有單位會員1486個，超過11萬名會員，其中專科會員10000多名。
中國各省、自治區、直轄市、計劃單列市及壹些市、縣均成立了預防醫學會，預防醫學會的網絡體系已遍布全國。
中華預防醫學會機關設在北京。辦事機構設有綜合協調部、學會學術部、報刊管理部、對外聯絡部與項目辦公室、繼續教育與科普宣教部、科技評審部、科技服務部、信息服務部、規劃財務部和期刊編輯部等。
中華預防醫學會目前下設46個分支機構，即46個分會、專業委員會，涵蓋了預防醫學和保健領域的各專業。