想要了解植物裏RLK的分類以及和動物RTK在演化上的關系。
材料：查找全部發布的RLK序列，用激酶域做blast
方法：
序列註釋：將所有序列依據pfam和smart搞出結構域。
序列比對：利用CLUSTALX做激酶域的多序列比對。
最優標準和PAUP程序參數：用不同的建樹方法和參數調式結果
利用CLV1和NAK的激酶域去blast釀酒酵母，秀麗隱桿線蟲，果蠅和人?E value <10-10建樹
結果：
在擬南芥基因組中，依據胞外域可以分為22個的大類，如下圖所示。依據每個大類的激酶域進行劃分，例如數量最多的RLK-LRR依據激酶域可以分為13個亞家族，所以***分為44個亞家族。其中RLK-LRR類型是最多的，有兩百多的，其次是Lectin，這壹家族最重要的特性就是可以與糖結合。在演化樹上，在擬南芥所有激酶中RLK是單系分布，和擬南芥RLK最近緣的是動物中的Pelle，可能存在保守的功能。但是RTK和RLK都是單系，說明沒有最近的***同祖先，暗示著兩者不同的起源。
? 隨後作者就想找到RLK在真核生物中的同源物（其中酵母中並沒有找到），發現了五個RLK家族的動物同源物：果蠅中的Pelle激酶（DmPelle），秀麗隱桿線蟲中的Pelle-like激酶（CePelle）和人中的三個IRAK。 DmPelle，CePelle和IRAK1都是細胞質激酶，都與植物RLK屬於同壹進化枝。
? 那麽這些RLK在染色體上的分布情況呢？不統壹，有的家族如DUF26大多數聚在壹支上（35/40在四號染色體），LRR X,XI, and XIII在每個染色體都有分布，超過30%的RLK都在基因組上串聯重復2-19個基因，在4號染色體上的DUF26，34個都存在串聯重復，說明RLK中很多基因都至少發生了壹次染色體內復制事件。
參考文獻：
1 Shiu, S. H. & Bleecker, A. B. Receptor-like kinases from Arabidopsis form a monophyletic gene family related to animal receptor kinases. Proc Natl Acad Sci USA 98, 10763-10768 (2001).
2 Shiu, S. H. & Bleecker, A. B. Plant receptor-like kinase gene family: diversity, function, and signaling. Sci STKE 2001, re22 (2001).