漁業與海洋部（DFO）成立於1979年，1995年與加拿大海岸警備隊合並。根據《1979年政府組織法》規定，該部為國家海洋政策和計劃方面的聯邦職能部門，負責協調與海洋有關的聯邦政策和計劃。其宗旨是為了加拿大人現在和將來的利益，盡可能地提供壹個高標準的安全、健康和豐富的水和水生物的生態系統。具體職能是負責制定支持加拿大海洋和內陸水域經濟、生態和科學系統的政策和規劃；負責海上和內陸水中魚類資源的保護和可持續利用；指導和促進聯邦的海洋政策和計劃；為加拿大的全球經濟提供服務。該部還通過海岸警備隊參與提供海上導航服務（例如浮標、通訊）、破冰業務和有關的海洋立法以及北極東部海上運輸等工作。該部還在海洋科研技術、研究及開發方面與大學和產業界的專家合作。該部***擁有9個大科研所，分別設在紐芬蘭和不列顛哥倫比亞等地，從事漁業及海洋科學技術研究。聯邦政府對DFO的年度財政撥款大致為14.7億加元，DFO將其中14%用於生態保護，39%為工作人員的薪水開支，35%用於日常辦公費用，12%用於固定資產維護、維修等。其下設主要機構有：加拿大海道測量局、太平洋生物站、海洋科學研究所、淡水研究所等。
1.加拿大海道測量局（Canadian Hydrographic Service）
加拿大海道測量局於1883年建立，業務範圍包括海道測量、海圖制圖、海底地形與地球科學制圖、航海資料目錄、航路指南、潮汐表、潮流表的出版以及航海通告發布，已生產本國及鄰近海域紙質海圖1000幅、國際海圖7幅、NTX格式矢量海圖682幅、S-57第3版格式海圖329幅（相當於178幅紙質海圖）、光柵海圖541幅、數字自然資源圖110幅。有測量船1000噸級以下3艘、2212噸級1艘、4800噸級1艘。
2.加拿大Maurice Lamontagne研究所
是加拿大海洋與漁業部的12個研究中心之壹，也是世界著名的海洋科學研究中心。其主要任務是：開展有關海洋生物資源與海洋環境保護等方面的研究，同時對海洋環境進行綜合管理，對魚類生存環境進行研究。
3.海洋科學研究所（Institute of Ocean Sciences）
總部設在加拿大不列顛哥倫比亞省悉尼市。該所的研究領域包括：研究海洋物理學、海洋化學、海洋生態學和水文地理學等。
4.淡水研究所（Freshwater Institute）
該所建於1966年，總部設在馬尼托巴省溫尼伯市的Crescent大學。該所的研究領域包括：從事淡水養魚業的生物、技術和環境等方面的研究工作，具體包括研究湖泊汙染問題、酸化作用與放射性核素、湖水中營養物濃度增加效應、水體加富過程與控制、淡水中生物生產與分解的機制與過程、淡水漁業資源的有效加工與利用、天然水與汙染水中魚種的新陳代謝、繁殖與普通生態學、水產品質量、北極海洋哺乳動物普通生態學和北部工業開發對水生動物的影響。