(1)Southern blot雜交 將壹定量的DNA樣品用適當的限制性內切酶切割成不同長度的DNA片段,然後在瓊脂糖凝膠上進行電泳分離,如加樣量相等,酶解適當,則在用溴化乙錠染色時,應顯示長度及亮度均相等的DNA拖帶。電泳後的凝膠須經堿變性處理,使DNA解離成單鏈,然後用毛細管虹吸法或電轉移法,使凝膠上的單鏈DNA片段,按凝膠上相同的位置轉移到硝酸纖維素膜或尼龍膜,經適當洗滌、涼幹後,在80℃烤箱中加溫2小時,即可用於雜交。用於檢測DNA的已知探針,壹般由帶有該片段的細菌質粒中制備。純化的探針DNA壹般用放射性同位素32P或生物素、地高辛配基等標記。雜交前探針必須加溫至100℃變性處理。雜交後的膜在暗盒中進行放射自顯影後,即在壹定的位置顯示同標記探針特異地結合的陽性DNA條帶。Southern blot雜交法可檢測癌基因的存在及其擴增,也可檢測抑癌基因的雜合性丟失。
(2)Northern blot雜交 Northern blot雜交的原理與Southern blot雜交基本相同。所不同處在於,RNA遠不如DNA穩定,很容易被RNA酶降解,而RNA酶不僅廣泛存在,而且加熱至100℃也不能使其滅活,所以在操作RNA時所用的壹切器皿和溶液都必需經過嚴格的消除RNA酶的處理。另外,RNA的電泳必須在含甲醛或乙二醛的變性凝膠中進行。Northern blot雜交主要應用於檢測癌基因或基他腫瘤相關基因的過度表達,也可檢測抑癌基因的低表達或不表達。