1、分類不壹樣：外切酶按作用的特性差異可以將其分為單鏈的核酸外切酶和雙鏈的核酸外切酶。核酸內切酶分為DNaseⅠ和DNaseⅡ。
2、應用不壹樣：外切酶可以用來測定基因組DNA中壹些特殊的間隔序列和編碼序列的位置。核酸內切酶可用於分析病原微生物DNA，通過酶切消化DNA，來了解到病原微生物遺傳物質的壹定特性，對於動物病毒尤其是對疫苗毒、野毒及變異毒株的檢測具有重要的意義。
3、概念不壹樣：外切酶是壹類能從多核苷酸鏈的壹端開始按序催化水解3、5-磷酸二酯鍵，降解核苷酸的酶。核酸內切酶是在核酸水解酶中，為可水解分子鏈內部磷酸二酯鍵生成寡核苷酸的酶。
擴展資料限制性酶切反應速度與底物的性質有很大的關系，底物的單雙鏈結構、分子的構型、DNA鏈中酶識別位點的數目以及位點附近的序列等都影響著酶的催化反應。
***價閉合環(超螺旋構型)DNA比其相應的線性分子的酶解作用要慢，要使超螺旋構型DNA徹底降解，需要的酶量就大。
對於DNA-RNA雜合雙鏈的酶切作用，Molloy等用EcoRI等8種酶切時，結果其 DNA鏈可被切割，但酶用量比雙鏈DNA大20-50倍。部分限制性酶還可切割單鏈DNA，如 Hae Ⅲ等。
參考資料：
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