主要區別是，原產地不同、形態特征不同、特點不同，具體如下：
壹、原產地不同
1、馬犬
學名馬裏努阿犬，別名比利時馬裏努阿犬，馬犬，是比利時牧羊犬。
2、德牧
學名德國牧羊犬，別名黑背、德國狼犬、德國狼狗，原產地德國。
二、形態特征不同
1、馬犬
馬裏努阿犬外形勻稱、流暢、呈方形，其頭和頸部姿態非常優雅，它敏捷、肌肉強健、靈敏且富有活力；四肢站立時呈方形，從側面看，背線、前肢、後肢近似正方形，給人的印象是結實而不笨重。
2、德牧
德國牧羊犬體形適中，有輕微的延展性，強壯，有強健和發達的肌肉，以及強壯的骨骼，通體緊湊和諧。
三、特點不同
1、馬犬
活潑興奮、嗅覺靈敏、膽大兇猛、攻擊力強、警覺性高、探求反射強、銜取興奮、占有欲強、服從性好、體能好、奔跑快、跳躍性好、耐力持久。從工作領域角度講適應於刑事偵查、治安防範、緝毒、救援、檢驗檢疫等工作領域；從專業領域角度講適應於氣味鑒別、追蹤、物證搜索、搜捕、搜毒、搜爆、巡邏、警戒、守候、抓捕、防暴、救援等專業領域。
2、德牧
個性敏捷，且適合動作式的工作環境，經常被部署各種任務。因為體型高大，外觀威猛，且具備極強的工作能力，因此在全世界範圍以軍犬、警犬、搜救犬、導盲犬、牧羊犬、觀賞犬，以及家養寵物犬等身份活躍。
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