----國家海洋環境監測中心是國家海洋局直屬的公益性事業單位，主要職能是負責全國海洋環境監測的業務管理、海洋環境保護科學技術研究、海域使用管理技術支持。其基本任務是： ----（壹）擬訂全國海洋環境汙染監測和生態監測規劃、計劃及監測技術規範、技術標準、技術管理政策和規章制度；對全國海洋環境監測系統實施業務指導與協調。---
----（二）負責全國海洋環境監測網的組織管理、技術管理和信息管理，承擔全國海洋環境監測網辦公室的工作；負責海洋環境質量評價和預測工作，編制國家海洋環境質量公報。
----（三）負責海洋環境監測、汙染監測、生態監測及陸源入海汙染物監測等的業務組織、管理和技木支持；組織承擔國家重大海洋環境調查項目和業務化監測試點工作。
----（四）研究擬訂全國海洋環境保護、海洋生態保護與建設的規劃和海洋環境標準；擬訂全國重點海域排汙總量控制標準和實施方案、全國海洋石油勘探開發重大海上溢油應急計劃、海洋傾廢評價程序和標準；開展赤潮、海冰等災害的監測與評估。
----（五）承擔全國海域使用管理的技術支撐；承擔編制全國海洋功能區劃與海洋開發規劃有關內容；擬訂海域使用技術規範、標準，提供海域使用論證技術咨詢與服務。
----（六）建立並管理全國海洋環境監測數據庫，對監測數據資料進行審核與管理；建立海洋環境監測、海域使用管理信息系統（納入國家海洋綜合信息業務系統）。
----（七）負責海洋環境和海洋生態監視、執法監察的技術支持、溢油指紋庫和汙損事件數據資料庫的管理；承擔重大海洋汙損事件監測調查工作，編制重大海洋汙損事件技術報告，為海洋汙損事件的仲裁提供科學依據。
----（八）開展海洋環境保護、海洋環境監測和海域開發使用等方面的科學技術研究和有關的國際合作。
----（九）承擔全國海洋環境監測和海洋環境保護等人員的業務培訓任務。
----（十）承擔國家海洋局交辦的其他任務。