木芙蓉和海芙蓉的主要區別是，科目分類不同、形態特征不同、生境分布不同，具體如下：
壹、科目分類不同
1、木芙蓉
木芙蓉，是錦葵目、錦葵科、木槿屬植物。
2、海芙蓉
海芙蓉，是白花丹目、白花丹科、補血草屬植物。
二、形態特征不同
1、木芙蓉
落葉灌木或小喬木，葉寬卵形至圓卵形或心形，花單生於枝端葉腋間，花初開時白色或淡紅色，後變深紅色，外面被毛，基部具髯毛，蒴果扁球形，直徑約2.5厘米，被淡黃色剛毛和綿毛，種子腎形，背面被長柔毛。
2、海芙蓉
矮小半灌木，老枝黑褐色，密被殘存的葉柄基部；全株（除萼外）無毛。葉集於枝的上部（當年枝），肥厚，花序傘房狀，花序軸由葉腋抽出，穗狀花序通常由5-11個小穗組成；小穗含2-4花；外苞寬卵形，先端銳尖，萼檐白色，通常褶疊而微開張，裂片尖三角形，下部沿脈被毛，花冠淡紫紅色。
三、生境分布不同
1、木芙蓉
木芙蓉喜光，稍耐陰；喜溫暖濕潤氣候，不耐寒，喜肥沃濕潤而排水良好的砂壤土。中國遼寧、河北、山東、陜西、安徽、江蘇、浙江、江西、福建、臺灣、廣東、廣西、湖南、湖北、四川、貴州和雲南等省區栽培。
2、海芙蓉
生長於海灘沙地，海芙蓉主要分布在福建、釣魚島壹帶。
以上內容參考?百度百科-木芙蓉、百度百科-海芙蓉