領域不同。貿易保護主義是商業領域的自我保護政策，單邊主義是政治與外交領域的行為。
手段不同。貿易保護主義的主要手段是關稅、進口配額與減少進口。
目的不同。貿易保護主義是為了保護本國產業，單邊主義是為了落實對本國有利的外交政策與醜化他國。
貿易保護主義，通常簡稱保護主義（英語：Protectionism），是壹種為了保護本國產業免受國外競爭壓力而對進口產品設定極高關稅、限定進口配額或其它減少進口額的經濟政策。它與自由貿易模式正好相反，後者使進口產品免除關稅，讓外國的產品可以與國內市場接軌，而不使它們負擔國內制造廠商背負的重稅。
貿易保護主義經常被人們與重商主義和進口替代聯系起來。重商主義認為保持壹個可觀的貿易順差對壹個國家是很有利的。取決於是否征收關稅，貿易保護主義有兩個分支：傳統貿易保護主義（有意征收關稅）和現代貿易保護主義（無意征收關稅）。（維基百科－貿易保護主義）。
單邊主義指的是國際社會中實力地位較強的某壹個國家，為了落實對本國有利的外交政策而忽視多數國家的人民意願，違反國際社會潮流，不顧他國利益，拒絕采取協商途徑，憑借自己的力量我行我素的行為。單邊主義往往被當作負面標簽，直接往政治對手身上貼，以達到醜化該國政治形象的目的，並通常具有民粹主義及民族主義的色彩。