輸水方式：采用正向進水、兩側對稱布置地下主輸水廊道、各閘室4區段8支廊道等慣性出水加消能蓋板、旁側泄水的形式。
船閘運行主要設備：壹閘首事故檢修門與疊梁門及橋式啟閉機，第壹至第六各閘首人字門及液壓啟閉機，第六閘首浮式檢修門；輸水廊道布置有進水口攔汙棚、各級閘室輸水工作閥門及液壓啟閉機、上下遊側檢修閥門；第六閘首布置有輔助泄水閥門及液壓啟閉機，上下遊側檢修閥門；閘室布置有浮式系船柱，二、三閘首布置有人字門防撞警戒裝置；其它閘面上相應還布置有：變電所，檢修排水泵，滲漏排水泵。
控制系統：現地控制系統和集中控制系統。集中監控系統 負責三峽船閘過閘流程的邏輯關系控制與保護，即嚴格按照通航條件、三峽船閘過閘工藝流程和船閘閘門、閥門之間的閉鎖保護控制條件，對現地控制站發布控制命令，並采集各現地控制站的運行狀態等信息。
集控系統的控制方式主要有：集中手動、集中半自動、集中自動三種。集中監控系統設備 由計算機監控系統、通航信號及廣播指揮系統、工業電視監視及船舶探測系統等組成。現地控制系統 嚴格按照相鄰現地控制站閘門、閥門之間的閉鎖保護控制條件對本站現地機壹電壹液設備進行控制與保護。現地控制系統 由冗余配置的PLC系統、外部傳感器及執行元器件等組成。現地控制系統的控制方式主要有“集控”、“現地”、“檢修”三種。每個閘首設有兩個現地控制站（簡稱現地子站），分別布置在閘首兩側的啟閉機房內，壹線船閘***12個子站，兩線船閘***設24個子站。
每個閘首各布置壹套兩扇人字閘門作為閘室的工作閘門，南北兩線***12套24扇人字閘門，由液壓直推式啟閉機啟閉。人字閘門門葉為平板主橫梁式結構。每線船閘各閘首對稱布置兩臺雙作用、中間支承雙向擺動、臥式安裝的液壓直聯式人字門液壓啟閉機，***24臺 。
在每壹閘首段的兩側各設有壹個液壓啟閉機房，每個液壓啟閉機房設壹套液壓泵站。現地子站和液壓泵站及其它傳感設備壹起完成該閘首的人字門及相應輸水閥門液壓啟閉機的操作和控制。
每級輸水閥門***布置工作閥門2扇，南北線***24扇工作閥門。輸水廊道工作閥門采用反向弧形門，由全包式門體結構、懸臂式支鉸軸、自潤滑軸承和支鉸座等組成。輸水閥門液壓啟閉機在每線船閘的各閘首兩側對稱布置，布置於各閥門井頂部，為下部銷軸豎缸式，***24臺，液壓油缸通過吊桿系統與反弧門相連 。
每線船閘壹閘首各布置有壹扇事故檢修門及4根疊梁門，事故檢修門在船閘運行期間作為事故、檢修門應用，另外在運行初期水位為152.4m至156.00m時需作第壹閘首工作門使用，疊梁門與事故檢修門配合使用，置於同壹門槽。疊梁門和事故檢修門為平面桁架式滑動閘門。兩線船閘在上閘首布置有2臺2*2500KN雙向橋式起重機，每臺負責壹線，並互為備用。
橋機主要用於操作壹閘首疊梁門和事故檢修門。六閘首浮式檢修門為抽幹閘室檢修時擋水用，兩線***用壹套。檢修時由拖輪牽引至門槽沈放擋水。門體的下沈和上浮依靠浮門內兩邊水艙的進水和排水實現。
三峽船閘的資產管理由業主單位長江三峽開發總公司統壹管理，運行維護管理由長江三峽開發總公司委托三峽船閘處進行。三峽船閘處是交通部長江三峽通航管理局的下屬單位，但具有獨立法人資格，受委托實施三峽船閘設備設施的運行、維護管理。