陳德銘 部長：
領導商務部全面工作，分管人事司。
高虎城 國際貿易談判代表（正部長級）、副部長（兼） ：
分管辦公廳、歐洲司、機關黨委、離退休幹部局、中歐協會。
姜增偉 副部長：
分管市場秩序司、商貿服務司、臺港澳司、機關服務局、海峽兩岸經貿交流協會。
鐘山 副部長、國際貿易談判副代表（兼） ：
分管財務司、外貿司、公平貿易局、許可證局、外貿中心、會計學會、聯系貿易審計局，代管產業調查局、外貿發展局、紡織商會、企業協會、貨代協會。
蔣耀平 副部長：
分管產業司、信息化司、報刊總社、電子商務中心、機電商會。
易小準 副部長：
分管政研室、國際司、世貿司、交流中心、國際貿易學會、世貿組織研究會。
陳健 副部長：
分管合作司、亞洲司、承包商會、咨詢協會、合作學會、跨國公司研究會。
傅自應 副部長：
分管綜合司、援外司、西亞非洲司、研究院、培訓中心、統計學會。
王和民 紀檢組長：
分管紀檢組、監察局、機關紀委。
崇泉 國際貿易談判副代表（副部長級） ：
分管條法司、反壟斷局、各特派員辦事處、經濟合作局、各駐外經濟商務機構。
王超 副部長：
分管服貿司、外資司、美大司、投資促進局、輕工商會、五礦商會、外資協會、國際投資促進會、服貿協會。
房愛卿 部長助理：
分管市場建設司、市場運行司、流通促進中心。
仇鴻 部長助理：
分管外事司、食土商會、醫保商會。
機構設置 商務部***設28個內設機構，分別是：辦公廳，人事司，政策研究室，綜合司，條約法律司，財務司，市場秩序司，市場體系建設司，商貿服務管理司，市場運行調節司（國家繭絲綢協調辦公室），反壟斷局，對外貿易司，服務貿易司，機電和科技產業司（國家機電產品進出口辦公室），外國投資管理司，對外援助司，對外投資和經濟合作司，進出口公平貿易局，產業損害調查局，國際經貿關系司，世界貿易組織司（中國政府世界貿易組織通報咨詢局），亞洲司，西亞非洲司，歐洲司，美洲大洋洲司，臺港澳司，信息化司，外事司。
商務部各司（廳、局）主要職能辦公廳
主要職能:
負責文電、會務、機要、檔案等機關日常運轉工作；承擔信息、保密、新聞發布、政務公開、安全保衛等工作；編輯發行《中國對外經濟貿易文告》。
其他事項：
商務部在大連、天津、上海、廣州、深圳、海南、南寧、南京、武漢、青島、鄭州、福州、西安、成都、杭州、昆明***派駐特派員辦事處16個，行政編制120名。
人事司
主要職能:
承擔機關、直屬單位及駐外機構的人事管理、隊伍建設和教育培訓等工作。
政策研究室
主要職能:
研究經濟全球化、區域經濟合作、現代市場體系和現代流通方式的發展趨勢並提出對策建議；研究擴大對外開放、國內外貿易流通體制改革並就重大問題提出意見和建議；研究提出健全現代市場體系的綜合政策建議。
綜合司
主要職能:
組織擬訂國內外貿易和國際經濟合作的發展戰略、規劃；監測分析商務運行狀況，研究商務運行和結構調整中的重大問題，提出相關政策建議；承擔有關統計及信息發布工作。
條約法律司
主要職能:
起草有關法律法規草案和規章；提出我國經濟貿易方面的法規之間及其與國際多雙邊經貿條約和協定之間銜接的意見；承擔國際經貿公約擬訂的有關工作；審核多雙邊經貿條約和協定等談判文件；組織經貿領域多雙邊知識產權、投資（保護）協議對外談判；承擔爭端解決有關工作；承擔機關有關規範性文件的合法性審核工作；承辦相關行政復議和行政應訴工作。
財務司
主要職能:
研究提出與商務工作相關的財稅、金融、價格等政策建議；承擔商務部歸口的各項業務資金、專項基金、援外經費等的具體使用和管理工作，編報預決算並下達預算；承擔本部門的資產管理、基本建設和內部審計工作。
市場秩序司
主要職能:
承擔牽頭協調整頓和規範市場經濟秩序的相關工作；推動商務領域信用建設，指導商業信用銷售，建立市場誠信公***服務平臺；參與組織打擊侵犯知識產權、商業欺詐等工作。
市場體系建設司
主要職能：
組織擬訂健全規範市場體系的政策；推進流通標準化；牽頭組織規範零售企業促銷行為；指導大宗產品批發市場規劃和城市商業網點規劃、商業體系建設；推進農村市場和農產品流通體系建設；按有關規定對拍賣、典當、租賃、汽車流通和舊貨流通行業等進行監督管理。
商貿服務管理司
主要職能：
承擔商貿服務業（含餐飲業、住宿業）的行業管理工作；推動流通體制改革和連鎖經營、商業特許經營、物流配送等現代流通方式的發展；指導社區商業發展、流通領域節能降耗工作，提出促進商貿中小企業發展的政策建議；按照有關規定對成品油流通進行監督管理；指導再生資源回收工作。
市場運行調節司（國家繭絲綢協調辦公室） 、
主要職能：
監測分析市場運行、商品供求狀況，調查分析商品價格信息，進行預測預警和信息引導；承擔建立健全生活必需品市場供應應急管理機制相關工作；承擔重要消費品儲備（肉類、食糖、邊銷茶、小包裝食品等）管理和市場調控的有關工作；承擔酒類流通、生豬屠宰管理的相關工作和繭絲綢協調工作。
反壟斷局
主要職能：
依法對經營者集中行為進行反壟斷審查；指導我國企業在國外的反壟斷應訴工作；開展多雙邊競爭政策國際交流與合作。
其他事項：
商務部承擔《反壟斷法》規定的國務院反壟斷委員會具體工作。
對外貿易司
主要職能:
擬訂進出口商品管理辦法和目錄；承擔重要工業品、原材料和重要農產品進出口總量計劃的組織實施工作；編報進出口商品配額、關稅配額年度計劃並組織實施；擬訂和執行進出口商品配額招標政策；指導交易會、洽談會等貿易促進活動和外貿促進體系建設。
其他事項：
國家發展和改革委員會負責編制重要工業品、原材料和重要農產品的進出口總量計劃，商務部負責在國家發展和改革委員會確定的總量計劃內組織實施。糧食、棉花、煤炭由國家發展和改革委員會會同商務部在進出口總量計劃內進行分配並協調相關政策。
服務貿易司
主要職能:
牽頭擬訂服務貿易發展規劃；擬訂技術貿易政策和促進服務出口規劃、政策並組織實施；承擔技術進出口管理、服務貿易促進和服務貿易統計工作。
機電和科技產業司（國家機電產品進出口辦公室）
主要職能:
擬訂機電產品和高新技術產品進出口、成套設備出口和加工貿易管理政策和有關目錄並組織實施；承擔機電產品、高新技術產品貿易促進工作；擬訂進口機電產品招標辦法並組織實施；擬訂並執行國家出口管制政策，依法頒發兩用物項和技術進出口許可證件。
外國投資管理司
主要職能：
擬訂外商投資政策和改革方案並組織實施；研究外商投資情況並上報動態和建議；審核外商投資企業設立及其變更事項、重大外商投資項目合同章程及法律特別規定的重大變更；依法監督檢查外商投資企業執行法律法規、規章和合同章程的情況並協調解決有關問題；指導投資促進及外商投資企業審批工作，規範對外招商引資活動；承擔外商投資統計工作；指導國家級經濟技術開發區、蘇州工業園區、邊境經濟合作區的有關工作；會同有關方面擬訂並組織實施促進服務外包發展的規劃、政策，推動服務外包平臺建設。
對外援助司
主要職能：
擬訂並組織實施對外援助的政策和方案，推進對外援助方式改革；組織對外援助談判並簽署協議，處理政府間援助事務；編制對外援助計劃並組織實施；監督檢查對外援助項目的實施。
對外投資和經濟合作司
主要職能：
擬訂並執行對外經濟合作政策；依法管理和監督對外投資、對外承包工程、對外勞務合作和設計咨詢等對外經濟合作業務；擬訂公民出境就業的管理政策；承擔外派勞務和境外就業人員的權益保護相關工作；審核境內企業對外投資開辦企業（金融企業除外）、對外經濟合作企業經營資格；承擔對外直接投資、對外承包工程和勞務合作統計工作。
進出口公平貿易局
主要職能：
承擔進出口公平貿易的相關工作；調查對我出口商品實施的歧視性貿易政策、法律法規及其做法並進行相關磋商談判；建立進出口公平貿易預警機制；指導協調對我出口商品的反傾銷、反補貼和保障措施的應訴及相關工作。
產業損害調查局
主要職能：
承擔產業損害調查與裁決工作；建立並完善產業損害預警機制，開展產業競爭力調查、產業安全應對與效果評估；指導協調產業安全應對工作。
國際經貿關系司
主要職能:
擬訂並執行多邊、區域經貿政策；根據分工處理與多邊、區域經貿組織的關系；組織實施自由貿易區戰略；牽頭組織多邊、區域及自由貿易區等經貿對外談判；承擔聯合國等國際組織對中國經濟技術合作的中方有關管理事務；管理多雙邊對中國的無償援助和贈款（不含財政合作項下外國政府及國際金融組織對中國贈款）。
世界貿易組織司（中國政府世界貿易組織通報咨詢局）
主要職能:
承擔牽頭組織世界貿易組織框架下的多雙邊談判工作；承擔世界貿易組織爭端解決機制工作；履行在世界貿易組織中承擔的關於貿易和投資等方面的政策審議、通報、咨詢義務；推進進出口貿易標準化工作。
亞洲司
主要職能:
擬訂並組織實施與所負責國別（地區）經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊、區域政府間經濟貿易聯委會、混委會等機制；組織雙邊、區域經貿談判；處理國別（地區）經貿關系中的重要事務；監督外國政府履行與我國簽訂經貿協議情況並承擔對外交涉工作，協助中國企業獲得外國市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
西亞非洲司
主要職能:
擬訂並組織實施與所負責國別（地區）經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊、區域政府間經濟貿易聯委會、混委會等機制；組織雙邊、區域經貿談判；處理國別（地區）經貿關系中的重要事務；監督外國政府履行與我國簽訂經貿協議情況並承擔對外交涉工作，協助中國企業獲得外國市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
歐洲司
主要職能:
擬訂並組織實施與所負責國別（地區）經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊、區域政府間經濟貿易聯委會、混委會等機制；組織雙邊、區域經貿談判；處理國別（地區）經貿關系中的重要事務；監督外國政府履行與我國簽訂經貿協議情況並承擔對外交涉工作，協助中國企業獲得外國市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
美洲大洋洲司
主要職能:
擬訂並組織實施與所負責國別（地區）經貿合作發展戰略、規劃和政策；建立雙邊、區域政府間經濟貿易聯委會、混委會等機制；組織雙邊、區域經貿談判；處理國別（地區）經貿關系中的重要事務；監督外國政府履行與我國簽訂經貿協議情況並承擔對外交涉工作，協助中國企業獲得外國市場準入；管理與未建交國家的經貿活動。
臺港澳司
主要職能:
擬訂並執行對香港、澳門特別行政區以及臺灣地區的經貿規劃、政策；牽頭組織與香港、澳門特別行政區有關部門和臺灣地區受權機構進行經貿磋商；會同有關方面承擔內地與香港、澳門特別行政區更緊密經貿關系安排磋商及實施工作；協調處理對臺經貿工作中的重大問題，擬訂對臺直接通商方案；牽頭處理多雙邊經貿領域的涉臺問題；管理和指導對臺貿易，協調臺商投資管理工作。
信息化司
主要職能：
擬訂運用電子商務開拓國內外市場的相關政策、措施；擬訂商務領域電子商務相關標準和規則；建立完善商務信息公***服務體系；承擔部電子政務及政府網站管理工作；組織進出口預警、市場運行和商品供求監測體系建設。
外事司
主要職能：
擬訂部外事工作制度；承擔有關外事工作。
機關黨委
主要職能：
負責機關、駐各地特派員辦事處、在京直屬單位的黨群工作。
離退休幹部局
主要職能：
負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位的離退休幹部工作。