科屬不同：防風屬於傘形科、防風屬、防風種，防己屬於防己科、千金藤屬、防己種。
外觀不同：防風的根莖較粗壯，形狀為圓柱形，顏色為淡黃棕色，莖單生，基部分枝較多，基生葉叢生，防己本身屬於粉防己植株的幹燥根莖，形狀呈圓柱狀，肉質，外皮為淡棕色，具有橫紋。
產地不同：防風主產地為河北、寧夏、甘肅等省份，防己主產地為廣東、廣西等省份。
壹、科屬不同
1、防風：屬於傘形目、傘形科、脂膠芹族、防風屬、防風種。
2、防己：屬於毛茛目、防己科、千金藤屬、防己種。
二、外觀不同
1、防風：莖單生，基部的分枝較多，大約與主莖等長，基生葉叢生，有扁長的葉柄，基部有寬葉鞘，葉片呈卵形，根莖呈圓柱形，較粗壯，顏色多為淡黃棕色。
2、防己：植株為多年生落葉藤本植物，本身屬於粉防己植株的幹燥根莖，形狀壹般為圓柱狀，呈肉質，外皮壹般為淡棕色或棕褐色，具有橫紋。
三、產地不同
1、防風：主產於河北、寧夏、甘肅、遼寧、內蒙古、山西、山東、陜西、黑龍江、吉林等省區，壹般長在草原、丘陵、多礫石的山坡上面。
2、防己：主產於湖南、廣東、廣西等省份。