皺鰓鯊體長1.5米左右，最長雌鯊可達近兩米。和普通的鯊不壹樣，口不是附著在下方，而是在前方，吻極短。上下頜牙同形。每牙具3個長齒尖，側面的線紋成溝狀，鰓孔有6對，牙齒成“山”字形，很像約在4億年前出現的鯊的祖先——枝齒鯊。
這種鯊魚有壹個非常容易識別的身體和類似尾部的鰭，身體延長呈鰻形，吻部極短，眼睛沒有瞬膜。在這種鯊魚的身體兩側有6條鰓裂，鰓間隔延長而褶皺，而且相互覆蓋，所以命名為“皺鰓鯊”。
最前面的壹條鰓裂延伸到喉嚨的下方，在鰓的邊緣還有類似的皮膚的細長片。背鰭只有壹個，位於臀鰭後上方，小於胸鰭。尾鰭寬長，末端較尖。