冰凍切片和石蠟切片區別是冰凍切片操作便捷性高，能很好保持抗原活性、脂肪、類脂成分。石蠟切片組織形態好，能切更大組織，切片厚度薄，連片性好，保存年限更長。
冰凍切片是壹種在低溫條件下使組織快速冷卻到壹定硬度，然後進行切片的方法。冰凍切片壹般在30分鐘之內就可以得到病人病理報告。因其制作過程較石蠟切片快捷、簡便，而多應用於手術中的快速病理診斷。
石蠟切片是首先需要將切下的病變組織器官作壹系列技術處理，包括固定、取材、脫水、浸蠟、包埋、切片和染色等，壹般需花費24小時方可完成全部制片過程，然後由病理醫生用顯微鏡觀察，並做出診斷。這種檢查方法稱為常規石蠟切片，是病理檢查中最常用的方法。
冰凍切片病理診斷對手術治療有重大幫助和指導意義，診斷要力求正確、迅速和可靠。然而，快速冰凍切片要在如此之短的時間內做出診斷，難度相當高，風險也高。冰凍切片並不是萬能的，有壹定的延遲診斷率和誤診率。但是對於手術方案的選擇卻是不可或缺的。