1.貫徹國家和自治區支持中小企業發展的方針政策，研究區域性中小企業服務體系發展規劃。向政府有關部門反饋各類中小企業經營發展的動態信息，為政府部門及時制定經濟調控措施提供依據。
2.直接為中小企業的創業和發展提供創業輔導、管理咨詢、人才培訓、投融資咨詢、技術創新和技術引進、信息化、區域和國際合作等綜合服務。
3、維護中小企業合法權益，協調解決中小企業發展過程中遇到的問題和困難，對具有發展潛力和特色的創業項目和成長性好的中小企業給予金融、法律和政策信息等支持和引導。
4.在政府部門的指導下，協調和引導各類社會中介組織為中小企業提供社會化綜合服務，提升和改善新疆中小企業的管理和技術水平，增強其核心競爭力；同時，協助政府部門規範社會中介組織的服務行為，建立社會中介組織為中小企業提供服務的監督評估體系。
5、與國內外企業服務和金融機構合作，通過市場化運作，為企業開展技術創新項目融資擔保及相關咨詢、策劃業務，促進新疆中小企業技術進步。
6.建立中小企業信息服務平臺，管理新疆中小企業信息網絡，完善新疆中小企業三大數據庫(基礎數據庫、新產品新技術數據庫、專業人員和社會中介服務機構數據庫)，搭建我區中小企業與政府部門和服務機構溝通的“網上橋梁”。
7.負責新疆中小企業協會建設和管理，承擔協會秘書處日常事務，搭建中小企業與企業家交流合作平臺。
8.通過發行與中小企業服務相關的出版物和宣傳資料，宣傳國家的方針、政策、法律法規；通報產業發展和經濟運行動態；介紹我區中小企業的成功案例和特色產品；向政府有關部門反映中小企業的呼聲並提出工作建議。