關於阿摩羅識之名，《金剛三昧經》、《大乘密嚴經》卷下、《大佛頂首楞嚴經》卷四、《決定藏論》卷上、《三無性論》卷上、《轉識論》、《十八空論》、《大莊嚴論經》卷六等均有記載。不過將阿摩羅識列為第九識，而提倡九識之說，則始於梁·真諦三藏。圓測《解深密經疏》卷三（卍續34·719下）∶
‘真諦三藏依決定藏論立九識義。如九識品說。言九識者眼等六識大同識論。第七阿陀那此雲執持，執持第八為我我所。唯煩惱障而無法執，定不成佛。第八阿梨耶識自有三種∶(壹)解性梨耶有成佛義。(二)果報梨耶緣十八界。故中邊分別偈雲，根塵我及識，本識生似彼。依彼論等說，第八識緣十八界。(三)染汙阿梨耶，緣真如境起四種謗，即是法執而非人執。依安慧宗作如是說。第九阿摩羅識此雲無垢識，真如為體。於壹真如有其二義∶(壹)所緣境名為真如及實際等。(二)能緣義，名為無垢識，亦名本覺，具如九識章引決定藏論九識品中說。’
可知真諦依據《楞伽經》及《決定藏論》等經論立九識義。其中之第七阿陀那為唯煩惱障我執，而無法執。第八阿梨耶有解性、果報、染汙三種義，其中之染汙阿梨耶即法執，緣真如，起四種謗；果報阿梨耶緣十八界，解性阿梨耶有成佛義。第九阿摩羅識即本覺，取真如二義中之能緣義故名為識。
又，慧遠《大乘義章》卷三雲（大正44·530c）∶
‘亦得說九。故楞伽經總品中雲∶八九種識，如水中之波。其狀如何？分別有二∶. 壹真妄分別以說九種。妄中分七，謂六事識及與妄識。真中分二，謂阿摩羅及阿梨耶。義如上辨。以此通前故合有九。(二)真妄離合以說九種。獨真為壹，所謂本凈阿摩羅識。真妄和合***為八種。義如上辨。***為本識阿陀那識及起六識。通前九也。’
此二義中，真妄分別義是約阿梨耶不失真而攝屬於真，真妄離合義是因阿梨耶等為真妄和合，故此二義系相對於阿摩羅的唯真離妄所作的分別。智顗《金光明經玄義》卷上雲（大正39·4a）∶
‘庵摩羅識是第九不動識，若分別之即是佛識。阿梨耶識即是第八無沒識，猶有隨眠煩惱與無明合。別而分之是菩薩識。大論雲，在菩薩心名為般若。即其義也。阿陀那識是第七分別識，呵惡生死欣羨涅盤。別而分之是二乘識。’
《法華經玄義》卷五（下）雲（大正33·744b）∶‘庵摩羅識即真性軌，阿黎耶識即觀照軌，阿陀那識即資成軌。’皆與慧遠所論同義。後來靜嵩、道基等攝論師亦用九識義，法礪、大覺等師則在八識外另立第九庵摩羅識。
不過，玄奘等新譯家則依據《瑜伽師地論》等書而立八識說，認為阿摩羅無垢識是兼述第八阿賴耶的識性，或取第八的凈分而命名，並非有壹第九的識體；並破斥真諦將阿陀那作為第七識。因為玄奘認為阿陀那是阿賴耶的異名。
另外，《顯識論》卷壹另有與真諦之九識義不同的說法，其文雲（大正31· 878c）∶‘顯識者有九種∶(壹)身識，(二)塵識，(三)用識，(四)世識，(五)器識，(六)數識，(七)四種言說識，(八)自他異識，(九)善惡生死識。’
此中，所謂身識是轉作眼等五根相似之身的識；所謂‘塵識’是轉作色等六塵的識，又名應受識；所謂‘用識’是轉作眼識等六識的識，亦名正受識；所謂‘世識’是轉作過現未等三世，又生死相續不斷的識；所謂‘器識’是轉作外四大五塵等器世間及十方三世等的識，又名處識；所謂‘數識’是算計量度的作用；所謂‘四種言說識’是指見聞覺知的識；所謂‘自他異識’是指轉作六趣身自他各異的識；所謂‘善惡生死識’是壹切生死不離人天四趣的善惡，即轉作此等諸事的識。