困境二:三個訂單相互碰撞，對接困難。對接海關三單復雜，周期長，多系統對接協調難度大。跨境電商零售進口需要陽光通關，會涉及三單核驗。它要求商家的電商平臺，能與海關系統、保稅倉系統、支付系統對接，分別推送訂單、運單、支付單，滿足公告179，與海關開通的原始支付數據實時對接。這整個流程對於初創企業來說非常復雜，從流程梳理到對接需要很長時間。
困境三:系統難選，管理復雜跨境電商系統良莠不齊，難選，管理復雜。跨境電子商務涉及網上商城、OMS系統、分銷系統、商店POS和後端ERP的使用。如果不是成熟穩定的系統，很難滿足業務需求。隨著跨境試點城市增加到59個，對系統的開放性和對接能力的要求更強。
困境四:渠道單壹，銷售受阻，銷售渠道少，線上線下不融合，智能化低。跨境電商起步階段，大多是初創企業，或者傳統供應鏈B2B轉向B2C，需要面對C端，或者小b，因此，銷售渠道的拓展和管理非常重要。核心是建立利潤分成體系，通過利益規則搭建線上銷售渠道和線下合作店鋪，形成全渠道閉環整合，打通商品、會員、庫存、交易、訂單、服務、配送等環節。