1961年3月被國務院公布為第壹批全國重點文物保護單位。
1975保國寺大修，國家文物局和省、市有關部門極為重視，專門成立了維修領導小組。古建築專家李卓君和王仕倫兩位先生長駐寺中，指導維修工作，中國著名古建築專家和文物保護專家羅哲文、祁英濤多次到現場指導。這次維修徹底解除了歷代所加的“螞蟥攀”、“支撐柱”和各種名稱的附加構件，對全方位的部位構件位置進行校正；糟朽嚴重的構件在更新或局部更換時，盡可能地利用原有材料。
2007年，保國寺古建築博物館啟動大殿科技保護監測項目，對大殿材質、沈降、變形、環境等要素實施高科技的動態監測。截至2010年底，***收集環境數據5萬余組。
2013年被評定為國家AAAA級旅遊景區。