南通大學圖書館（The Library of Nantong University）由公立南通大學前身各院校的圖書館合並而成，分布在主校區、啟秀校區、鐘秀校區與啟東校區，館舍總面積47300平方米，閱覽座位2860個。
館內擁有豐富的電子文獻資源，藏有各種電子出版物，先後引進中國期刊全文數據庫、中文科技期刊全文數據庫、超星電子圖書、萬方博碩士學位論文、MEDLINE、Biosis Previews、ProQuest Health & Medcal Complete、Springer-Link文獻數據庫等中外文大型數據庫41個，電子圖書93.6萬冊，碩博士學位論文95.40萬篇。根據專業設置和學科發展需要，圖書館及時調整文獻信息資源的收藏策略，滿足了不同類型讀者對文獻信息資源的需求。
圖書館在充分利用校園網絡基礎上，館內局域網百兆交換到桌面，建立了功能完備的硬、軟件支撐體系，構建了SAN結構存儲訪問與自動備份系統，電子文獻信息存儲容量達16TB，構建了由網絡數據庫、本地數據庫和自建數據庫組成的、功能完善的網上信息資源服務體系，提供24小時在線中外文期刊全文、題錄、文摘和電子圖書的查詢、瀏覽和下載服務。圖書館應用匯文圖書館管理集成系統處理日常業務，圖書期刊采訪、編目、典藏、流通、公***查詢、館際互借、期刊管理等業務均實現自動化處理。