夏季是去長崎旅遊的最佳季節，最佳旅行時間是5-9月。長崎的年平均氣溫18℃，氣溫受到暖流的影響壹年中的最高氣溫和最低氣溫的溫差較小，長崎是亞熱帶氣候，跟東南亞比較相似，具有濃厚的南國風情。鄰近海洋，是消夏避暑的好地方。浪漫海灘邊海風習習，涼爽宜人。
長崎又是著名溫泉勝地。這裏的雲仙溫泉是人們休養的好去處，十分有名。這裏的溫泉水質是乳白色的硫磺泉，對寒虛體質、皮膚病等都有很好功效。此外，小濱溫泉也是長崎的著名溫泉之壹。泉水溫度高達80到100℃左右，以其溫泉水溫度日本最高而聞名。小濱溫泉的水質屬於單純性含鈉溫泉，主要功效是治療神經疼痛、風濕癥、婦女病等。無論什麽季節來了長崎都不要錯過哦。
在這段期間時間還可以參加當地的節慶龍舟競渡賽和盂蘭盆活動。長崎龍舟競渡（長崎ペーロン選手権大會）是日本長崎市長崎港每年夏季舉行的龍舟競渡，自江戶時代初期開始，至今已有超過三百五十年歷史，是日本除沖繩縣外第壹個出現的龍舟競渡，也是全日本最著名的龍舟競渡之壹，於每年7月最後壹個星期日舉行。
盂蘭盆活動為了追悼逝者，在世的生者便制作了這些精靈船(對逝者的稱呼)為逝者們送行。而牽引著這些船們在街上遊行並將逝者送回西方極樂凈土便是長崎的盂蘭盆傳統文化。這些船們有各式各樣大小、花樣及燈籠裝飾，並且會在船上裝飾代表逝者的東西。遊行從傍晚開始並壹直持續到深夜。於8月15日舉行。